根據官網，霍華德·休斯醫學研究所（The Howard Hughes Medical Institute, HHMI）是美國一個非營利性醫學研究所。1953年12月17日，著名飛行員、工程師霍華德·休斯建立了以他的名字命名的霍華德·休斯醫學研究所。其目的是進行基礎研究，探討生命本源。HHMI的憲章規定：“霍華德-休斯醫學研究所應促進人類知識領域內的基礎科學（主要是醫學研究和醫學教育領域）和有效應用、造福人類。”

1976年，作為HHMI唯一受託人的霍華德·休斯去世。特拉華州法院大法官在1984年任命了一批新的憲章受託人。受託人在1985年作出重大決定，出售研究所的唯一資產—休斯飛機公司，建立一個更靈活的支援生物醫學研究的基金會。

1984年，霍華德·休斯醫學研究所的科學家的研究集中在四個領域—細胞生物學、遺傳學、免疫學和神經科學，1986年加進結構生物學。

霍華德·休斯醫學研究所在整個生物學界聘用有新穎想法和有影響力的科學家來擔任研究員，但他們的研究仍在原研究機構的實驗室進行。

過去30年，霍華德·休斯醫學研究所在Choppin（1987-1999），Thomas R. Cech（2000-2009）及Robert Tjian（2009-至今）的領導下取得了巨大成就，成為生物醫學研究和科學教育的重要推動力量。霍華德·休斯醫學研究所的科學家正在增加我們對社會最棘手的一些健康難題的理解—包括艾滋病、心血管疾病、癌症和糖尿病，其最終目標是改善人們的生活質量。

霍華德·休斯醫學研究所的研究員專案是與超過60個美國的著名大學、醫院、機構和醫學學校建立聯絡，創造環境，並提供靈活、長期的資金支援超過300名的休斯科學家及他們的研究團隊。

霍華德·休斯醫學研究所的研究員的創造力和成就被廣泛認可。現在有超過180名霍華德·休斯醫學研究所的研究人員是美國國家科學院的院士以及25個諾貝爾獎得主。