滷水點豆腐的原理是因為，豆腐的原料黃豆富含蛋白質，蛋白質含量36～40，經水浸、磨漿、除渣、加熱，得到的蛋白質的膠體(一種介於溶液和懸濁液、乳濁液之間的混合物)。點豆腐就是設法使蛋白質發生凝聚而與水分離。

鹽滷是結晶氯化鎂的水溶液，屬電解質溶液，可以中和膠體微粒表面吸附的離子的電荷，使蛋白質分子凝聚起來得到豆腐。

聚沉是一種物理現象，指向膠體中加入電解質溶液時，加入的陽離子（或陰離子）中和了膠體粒子所帶的的電荷，使膠體粒子聚整合較大顆粒，從而形成沉澱從分散劑裡析出。(膠體穩定的原因是膠粒帶有某種相同的電荷互相排斥，膠粒間無規則的布朗運動也使膠粒穩定。因此，要使膠體聚沉，其原理就是：中和膠粒的電荷或加快其膠粒的熱運動以增加膠粒的結合機會。)

既然點豆腐是讓蛋白質發生凝聚，所採用的凝膠劑就不一定是非鹽滷不可，其他如石膏、酯酸、檸檬酸等都有相同的作用，都可用來點豆腐。這裡還有值得一提的是，近年來在市場上銷售一種盒裝豆腐，它潔白細膩，質量明顯高於傳統方法制做的豆腐，原來，它的凝固劑採用了一種新的化學物質——葡萄糖酸內酯，這也是新科技用於食品加工的一個例子。

簡單點說,滷水豆腐就是用鹽滷（氯化鎂）點制的豆腐，石膏豆腐就是用硫酸鈣點制的豆腐。