首先，破壞原生環境。如果“砍頭樹”來源於森林、農家房前屋後或農田林網，大量將大樹從這些地方移走會破壞當地生態系統，成為水土流失、洪澇災害等自然災害頻發的隱患。挖掘大樹過程中可能會將一些達不到需求者標準的小樹連根拔起，使林水資源遭受破壞。一旦農村和森林的“大環境”被嚴重破壞，即使花再多錢也無法改善城市“小環境”。

　　其次，大樹成活率低。李慶衛說，小樹可塑性強，成活率相對較高，大樹則完全不同。從農村山裡到城市，生存環境發生巨大變化，加之挖樹時會斷掉很多根系且以大主根居多，如果沒有經過苗圃的馴化，養護不得當，非常容易死亡。有些樹種並不適合城市，如山上年齡較長的油松已經適應了山上寒冷的環境，到了城市燥熱環境中，就容易得病死亡。“砍頭樹”的成活率很低，僅有50%~60%，這種低成活率反而會給城市景觀發展和當地生態文明建設幫倒忙。

　　再次，很難起到綠化效果。彭麗芬說，“砍頭樹”往往經過“大抹頭”，強修剪，原來的枝繁葉茂已不復存在，短期內仍難形成好的景觀效果。大樹再生能力較弱、可塑性差，移栽後2~3年內可能處於假活狀態，即使3~5年後真能成活，也可能因根系和樹冠創傷導致樹勢變差，缺乏生機，起不到綠化效果。大樹的枝葉被砍殆盡，以至於它運到城市後的恢復速度變慢，枝葉必須要從嫩枝嫩葉一點點恢復，從這個角度講，希望透過移植“砍頭樹”達到城市景觀上立竿見影的改變是不切實際的。

　　最後，蒙受經濟損失。年齡越大的樹成活率越低，古樹一旦死亡，不僅自然資源白白流失，還會使國家蒙受巨大經濟損失。