印尼和越南的糾紛，目前主要是兩國有爭議海域的海上糾紛。印尼和越南在海上的糾紛由來已久，雙方經常發生衝突。雙方均認為在爭議海域享有合法權益，多年來鬥爭不斷。

越南為了形成佔領事實，鼓勵大批的漁民到該地區捕魚。印尼則對敢於在這片海域捕魚的漁民下重手。據媒體報道，2019年4月28日印度尼西亞海軍在該國海域攔截了一艘正在進行非法捕魚作業的越南漁船。可沒過多久，一艘越南漁政船KN-213就直接撞向印尼海軍帕西姆級護衛艦381 KRI Tjiptadi“提普塔迪”號。印尼海事與漁業部部長蘇西在29日宣佈，印度尼西亞政府將在5月4日炸燬51艘被扣押的非法漁船。值得注意的是，這51艘非法漁船中的大多數為越南漁船。近些年來，印尼開始直接扣押敢於在這片海域捕魚的漁船，並抓捕漁民。此次雙方發生衝突就是印尼海軍要抓捕漁民，越南漁政阻撓造成的。越南漁政船雖然小，但是船員的戰鬥精神非常的強，直接駕船高速撞向印尼護衛艦。兩船相接後，越方雖然人數不佔優勢，但是依然用棍棒和槍支與印尼海軍打鬥。印尼海軍的反擊也非常的直接，不僅叫罵越南漁政人員，還登船砸毀了船上的裝置。

根源:兩國在納土納群島有領土領海爭端。

在南海九段線之外有一個納土納群島，那個地方在古代被中國最早發現和使用，鄭和下西洋後華人在那管理了200年，直到荷蘭殖民者開始殖民那裡為止，荷蘭殖民者離開後納土納群島實際被印尼控制。對於納土納群島，除了印尼之外的聲索國還有越南。