題主沒有明確給出疼痛的範圍，做的什麼手術，手術時擺放的什麼體位，手術時間多久，採用的什麼麻醉方式？因為這些方面都有可能導致手術後肌肉疼痛。下面我詳細分析一下:

一、如果採用的全身麻醉，那麼麻醉醫生應用的去極化肌肉鬆弛藥可以導致肌肉強烈收縮，可能會出現“術後肌痛”。

二、長時間的手術，長時間受到牽拉的肌肉會出現手術後疼痛。

三、特殊體位長時間被壓迫的位置術後麻木疼痛。

四、如果是手術切口周圍疼痛，極有可能是因為手術操作時的牽拉導致的。因為手術醫生在能夠滿足手術的前提下，為了追求美觀，手術切口儘量縮短，手術時需要助手用拉鉤分開肌肉、血管及神經等，所以有可能導致術後的肌肉疼痛。

一般被麻醉的區域包含術區，也就是手術操作的區域。手術本身就是一種損傷，雖然手術很成功，大部分術後切口癒合良好，但有些損傷恢復的可能比較慢，幾個月或幾年，有的則是不可恢復的，比如組織瘢痕、結締組織（無菌性）炎症黏連、縫合線結或其它醫用物品的炎性包裹等等，這些都是不可避免的，可能會引起區域性缺血、壓迫神經、炎性刺激、牽拉等，都可以引起區域性疼痛。患者術後可以採取相應的治療手段來緩解區域性症狀，有的需要時間自我修復。不同的人群、不同的手術，所引起的症狀也各不相同，可以諮詢專業人員（術後康復科）進行相應的指導治療，大多數症狀都能緩解或消失。個人觀點，僅供參考。