它們的區別在以下三個方面：

1、用途不同

T檢驗，主要用於樣本含量較小（例如n < 30），總體標準差σ未知的正態分佈。

單因素方差分析用來研究一個控制變數的不同水平是否對觀測變數產生了顯著影響。

2、分析步驟不同

單因素方差分析的第一步明確觀測變數和控制變數。單因素方差分析的第二步剖析觀測變數的方差。方差分析認為：觀測變數值的變動會受控制變數和隨機變數兩方面的影響。據此，單因素方差分析將觀測變數總的離差平方和分解為組間離差平方和和組內離差平方和兩部分，用數學形式表述為：SST=SSA+SSE。

單因素方差分析的第三步透過比較觀測變數總離差平方和各部分所佔的比例，推斷控制變數是否給觀測變數帶來了顯著影響。

t檢驗步驟：建立假設、確定檢驗水準α；計算檢驗統計量；查相應界值表，確定P值，下結論。

3、條件不同

t檢驗的前提：來自正態分佈總體；隨機樣本；均數比較時，要求兩樣本總體方差相等，即具有方差齊性。

方差分析的條件：實驗條件，即不同的處理造成的差異，稱為組間差異。用變數在各組的均值與總均值之偏差平方和的總和表示，記作SSb，組間自由度dfb。隨機誤差，如測量誤差造成的差異或個體間的差異，稱為組內差異，用變數在各組的均值與該組內變數值之偏差平方和的總和表示， 記作SSw，組內自由度dfw。