臺灣海峽季風交替明顯，頻繁的偏北風非常強勁。每年10～4月東北風為主；6～8月西南風為主。
每年強烈的颱風伴隨暴雨，造成潮水位變化劇烈，對沿岸侵蝕很強烈。
臺灣海峽屬南亞熱帶、北熱帶季風氣候。中部氣溫平均最高28.1℃，最低15.9℃。西北部受大陸影響，氣溫年差較大；東南部受海洋影響，年差和日差較小。10月至翌年3月多東北季風，風力達4～5級，有時6級以上；5～9月多西南季風，風力3級左右。7～9月多熱帶氣旋，每年受熱帶風暴和颱風影響平均5～6次，中心透過平均2次。陰雨天較多，但降水量較兩岸少，年降水量800～1500毫米；東北季風期、西南季風期多，秋季較少。海峽中霧日較少，澎湖列島年平均3～4天；兩側近岸霧日較多，東山島、馬祖列島和高雄一帶，每年超過30天，其餘在20天以下。
受黑潮影響，水溫較高，鹽度和透明度也較大。年平均表層水溫17～23℃，1～3月水溫最低，平均12～22℃；7月最高，平均26～29℃、平均鹽度33‰，西北側30‰～31‰，東南側為33‰～34‰。透明度東部大於西部，平均3～15米。水色東部藍色，西部藍綠色，河口或氣候不良時呈綠黃色。
福建沿岸、澎湖列島和海口泊地以北臺灣西岸為正規半日潮；海口泊地以南臺灣西岸為不正規半日潮；其中岡山至枋寮段為不正規全日潮。潮差西部大於東部，西部金門島以北為4～6米，往南顯著減小；東部中間大於兩端，後龍港達4.2米，海口泊地和淡水港為2.6米，海口泊地以南為0.6米，澎湖列島1.2～2.2米。後龍港至海壇島一線以北，漲潮流向西南，落潮流向東北，流速0.5～2節；以南流向與上述相反。流速在澎湖列島附近較大，東南部可達3.5節。
海峽為東海風浪較大地區。湧浪多於風浪，以4級浪最多，佔全部海浪42%，5級佔28%，大於5級的佔8%。東北季風季節，以東北-北向浪為主。西南季風季節以西南-南向浪為主。在冬季寒潮和夏季熱帶氣旋影響下，可形成8～9級浪。海流為北上的黑潮西分支和南海流及南下的浙閩沿岸流所控制，並受季風影響。夏季沿岸流停止南下，整個海峽為西南季風流和黑潮西分支結合的東北流，流速一般0.6節，澎湖水道達2.3節。冬季受東北季風影響的沿岸流南下，西部和中部為西南流，流速約0.5節；東部的東北流減弱，當東北風強勁時，表層甚至改變為西南流。
臺灣海峽季風交替明顯，頻繁的偏北風非常強勁。每年10～4月東北風為主；6～8月西南風為主。
每年強烈的颱風伴隨暴雨，造成潮水位變化劇烈，對沿岸侵蝕很強烈。
臺灣海峽屬南亞熱帶、北熱帶季風氣候。中部氣溫平均最高28.1℃，最低15.9℃。西北部受大陸影響，氣溫年差較大；東南部受海洋影響，年差和日差較小。10月至翌年3月多東北季風，風力達4～5級，有時6級以上；5～9月多西南季風，風力3級左右。7～9月多熱帶氣旋，每年受熱帶風暴和颱風影響平均5～6次，中心透過平均2次。陰雨天較多，但降水量較兩岸少，年降水量800～1500毫米；東北季風期、西南季風期多，秋季較少。海峽中霧日較少，澎湖列島年平均3～4天；兩側近岸霧日較多，東山島、馬祖列島和高雄一帶，每年超過30天，其餘在20天以下。
受黑潮影響，水溫較高，鹽度和透明度也較大。年平均表層水溫17～23℃，1～3月水溫最低，平均12～22℃；7月最高，平均26～29℃、平均鹽度33‰，西北側30‰～31‰，東南側為33‰～34‰。透明度東部大於西部，平均3～15米。水色東部藍色，西部藍綠色，河口或氣候不良時呈綠黃色。
福建沿岸、澎湖列島和海口泊地以北臺灣西岸為正規半日潮；海口泊地以南臺灣西岸為不正規半日潮；其中岡山至枋寮段為不正規全日潮。潮差西部大於東部，西部金門島以北為4～6米，往南顯著減小；東部中間大於兩端，後龍港達4.2米，海口泊地和淡水港為2.6米，海口泊地以南為0.6米，澎湖列島1.2～2.2米。後龍港至海壇島一線以北，漲潮流向西南，落潮流向東北，流速0.5～2節；以南流向與上述相反。流速在澎湖列島附近較大，東南部可達3.5節。
海峽為東海風浪較大地區。湧浪多於風浪，以4級浪最多，佔全部海浪42%，5級佔28%，大於5級的佔8%。東北季風季節，以東北-北向浪為主。西南季風季節以西南-南向浪為主。在冬季寒潮和夏季熱帶氣旋影響下，可形成8～9級浪。海流為北上的黑潮西分支和南海流及南下的浙閩沿岸流所控制，並受季風影響。夏季沿岸流停止南下，整個海峽為西南季風流和黑潮西分支結合的東北流，流速一般0.6節，澎湖水道達2.3節。冬季受東北季風影響的沿岸流南下，西部和中部為西南流，流速約0.5節；東部的東北流減弱，當東北風強勁時，表層甚至改變為西南流。