對於BMI28以上的人群，在確認是腸道菌群紊亂引起的肥胖的前提下（透過相關體檢和腸道菌群基因檢測可以確認），可以透過而且也只能透過調節腸道菌群達到減肥的目標。

這種方法的依據在於，腸道菌群紊亂引起的肥胖，其實是慢性代謝綜合徵的一個發展階段，它的發生包括“代謝性內毒素血癥”和“代謝性菌血症”，前者是腸道菌群內有益菌減少，腐敗菌增加後，腸道產丁酸鹽等短鏈脂肪酸的有益菌丰度下降，腸道pH值升高，腸屏障被破壞，腸內細菌分泌的內毒素（LPS）和其他有害物質透過腸屏障轉運，進入血漿。後者是腸道內的某些活菌透過腸屏障，轉移到血漿中，因此，測血液中某些細菌基因的丰度在將來也可能作為缺認2型糖尿病的一個指標。

確認”代謝性血癥”跟肥胖相關，是透過直接給野生型小鼠注射“LPS”，按普通飲食餵養，小鼠也會發展成肥胖和糖尿病。而另一方面，用高脂高糖飲食餵養的導致肥胖的野生型小鼠，其血漿裡的LPS濃度也升高。

至於細菌易位對肥胖和糖尿病的影響，是在高脂高糖餵養致肥胖和2型糖尿病的野生型小鼠血液中測出某些菌群的基因丰度較高。

以上兩個因素，都是腸屏障被破壞後，炎性因子進入血漿，引起系統炎症，進一步導致胰島素抵抗，引起肥胖和糖尿病。

關於腸道菌群紊亂誘發對肥胖和2型糖尿病的機制，還有糞菌移植的實驗。把肥胖的實驗物件去除腸道內的所有菌群，移植一個瘦子的糞菌，正常飲食調節下，這個實驗物件不會發胖，體內不產生胰島素抵抗。而移植回其自身的糞菌後，正常飲食條件下，實驗物件仍然會發胖，產生胰島素抵抗。

從營養學的角度看，人們常常認為，因為攝入的能量過高，超過機體的能量需求，就會發胖，但是事實上也存在，同吃一樣的飯菜，有人發胖，有人不發胖。這就是腸道菌群屬於“胖”體質和“瘦”體質的差別。

所以，屬於腸道菌群紊亂引起的肥胖，可以透過高膳食纖維飲食，把腸道菌群從”胖體質”結構調整成”瘦體質“，並不需要嚴格的節食，運動，體重也會減少，而且非常有效，這類人群一般在高膳食纖維飲食干預後，一個月體重會下降10幾到20幾斤，較長時間的干預也有體重下降60幾公斤的記錄。

總之，透過調節腸道菌群結構減肥，對於BMI28以上人群是非常有效，安全，也可以改善體質的一個好辦法。

極端情況下，也可以實施糞菌移植，就是把胖子腸道中所有菌群都移除後，移植一個瘦子的菌群。

不過，因為腸道菌群數目龐大，科學家也努力的確認其中跟肥胖有關的菌群，如果把這些菌全部確認後，為精準飲食干預減肥將提供更明確的靶點。