1、權利不同：

日本是君主立憲制的國家，天皇只是虛位元首沒有實權，權掌握在由議會產生的責任內閣手裡，而作為內閣總理大臣的首相無疑是掌權者。

2、地位不同：

日本的天皇是國家的象徵，而首相則是國家政黨的領袖和政策的決策人。

3、稱號不同：

天皇

日本天皇是日本皇帝的稱號，也是神道教的最高領袖，乃現今世界中唯一使用皇帝（Emperor）稱號的無權君主，以其為首的日本皇室則是世界上現存的皇室更是日本國家的象徵。天皇制是世界歷史上最長的君主制度（書籍記載於1868年）。

首相

內閣總理大臣，簡稱總理大臣總理通稱首相，是日本內閣的最高首長，也是日本實際的政府首腦領導各行政機關運作。其產生方式是在國會議員之中擇一提名再經國會議決指名，在形式上由日本天皇任命。

擴充套件資料：

日本天皇的地位權力

日本天皇是日本國的象徵，是日本國民整體的象徵，其地位以主權所在的全體日本國民的意志為依據。

皇位繼承：皇位世襲，根據國會議決的皇室典範的規定繼承之。

日本天皇的許可權、天皇國事行為的委任：天皇只能行使本憲法所規定的有關國事行為，並無關於國政的權能；天皇可根據法律規定，對其國事行為進行委任。

日本天皇攝政：根據皇室典範的規定設定攝政時，攝政以天皇的名義行使有關國事的行為，在此場合準用前條第一項之規定。

日本天皇的任命權：天皇根據國會的提名任命內閣總理大臣；天皇根據內閣的提名任命擔任最高法院院長的法官。