理解自然地理環境的整體性，可以從以下兩個方面著手：第一，組成自然地理環境的各個要素並不是彼此孤立的，而是作為整體的一部分而發展變化的。各個要素透過特殊的網路關係形成自然地理環境的結構特徵，作為系統有機聯絡的反映，各個要素亞系統都從屬於自然環境系統本身，各個要素在特徵上保持協調一致，並與總體特徵相統一。第二，自然地理環境的整體性是透過系統內部物質、能量和資訊的運動而得以表現的，某一自然要素的變化必然導致其他要素以至整體環境狀態的變化。例如，濫伐森林、植樹種草對自然地理環境會帶來不同的影響。

自然地理環境的整體性是相對的，差異性卻是絕對的。一方面，不可能找到兩個自然狀況完全相同的區域；另一方面，再小的區域，其內部仍然存在著差異。所以，區域才可以一直逐級劃分下去。因為各個自然要素的分佈具有一定的規律性，它們共同作用而形成的自然地理環境在地域分異上也具有一定的規律性。地域分異規律是研究特定區域自然現象以及利用和改造自然環境的基礎和依據，它是建立在理想條件下的理想模式。

地理環境的整體性是指地理環境各組成要素和各組成部分之間的內在聯絡性。它們相互聯絡，相互制約，從而形成一個整體，這一要素影響另外要素，這一部分影響另一部分。如赤道附近的低平地區，由於獲得的太陽熱最多，形成高溫多雨氣候，從而為熱帶植物的生長創造了有利的條件；而多樣的植物和豐富的果實，又為多種多樣的動物提供了充足的食物來源。這種組成地理環境各要素之間的內在聯絡，就構成赤道低平地區地理環境的整體性。又如南美洲安第斯山東西兩側同緯度地區地理環境有明顯差異，這一整體乃是由於安第斯山這個要素起了重要的作用。

地帶性差異主要指陸地上的自然帶，沿緯線方向成一定寬度延伸，並按南北方向更替的帶狀規律性。地帶性差異的成因，主要是由於地球是一個橢球體，太陽輻射在地球表面的分佈不均勻，產生了沿緯向分佈的熱量帶。熱量分佈的地帶性，影響著水分的分佈，各個地帶不同的熱量和水分條件，又形成不同的氣候特徵。在地球上的氣壓帶和風帶的影響下，氣候也是按地帶分佈的。氣候影響植物，而植物與動物又有密切關係，因此，不同的氣候帶就有不同的植物帶和相應的動物界。這樣，在整個大陸上形成一系列按緯向分佈、南北更替、各個地理要素相互聯絡的自然帶。