軍事上，袁崇煥採用的是“堡壘戰術”，依靠堅城守衛，屬於正面戰場；毛文龍則以海上的皮島為基地，採取游擊戰術，另外還使用間諜戰，屬於敵後牽制騷擾。正面和遊擊的相結合，是明朝能夠在遼東和後金抗衡良久的法寶，兩人本來該是珠聯璧合的。

問題出在哪？戰略分歧。袁崇煥認為毛文龍該移鎮，轉移到遼東沿海作戰；而毛文龍認為，應該繼續堅持海島作戰。官司鬧到崇禎那，皇帝站了毛文龍這邊。

但皇太極很快攻下北韓，毛文龍很難再登陸，遊擊失去了以往的犀利，與袁崇煥難以協同的弱點也暴露出來，似乎證明了袁崇煥移鎮建議的正確。

再到後來，毛文龍的生存環境持續惡化，又爆出了與後金暗通款曲的傳言。儘管對於毛文龍是否有意投降後金，存在爭論，但至少他和皇太極是有書信往來的，而且和後金的使者也有不清不楚的來往。另外，在當時的環境下，一是毛文龍有投降的動機，二是毛文龍長期孤懸海外，朝廷也擔憂他難以駕馭。

於是，就有了袁崇煥借雙島閱兵為名，誘騙毛文龍繼而斬之的一幕。

由此可見，從軍事上，一、皮島後期的遊擊作用已不明顯；二、毛文龍投降會造成更大的損失。所以，毛文龍殺也就殺了，崇禎可能也認為該殺。但生殺大權應該掌握在皇帝手中，所以崇禎殺就沒什麼錯的，袁崇煥殺就是錯的，他後來的悲劇，也是因為此事導致和崇禎產生了罅隙。

另外，袁崇煥殺毛文龍前，說了句：“你道本部院是個書生,本部院卻是朝廷的一個首將。”顯然說明毛文龍平時可能看不起文官出身的袁崇煥，不服管教。袁崇煥的殺機很可能是來自私怨，這當然也是錯的。

即便毛文龍不死，遼東戰場的大局也不會改變，明朝也無力阻擋後金，只是過程可能會延緩一些。

正面對敵來說，當時都不能野戰戰勝後金的：一是軍隊腐敗，二是武備太差、訓練不足，三是糧餉不足。所以從正面戰場作戰來說，關寧軍都不能抵擋，更別提毛文龍了。其實這個道理很簡單，好比抗戰，關寧軍是國軍，那毛文龍就是游擊隊，畢竟國軍的補給比游擊隊好很多。國軍正面會戰都不能打贏小日本，游擊隊更是不可能與小日本正面硬抗了。因此毛文龍只能以騷擾為主，比如袁吹子們笑話的《滿文老檔》中記載的後金三婦女嚇退毛文龍三百兵，不過就是偷襲失敗被發現而撤退。

論斬首，袁吹子毛黑喜歡引用袁可立的“而不交一鋒致奴死二萬餘人馬三萬匹，其數終有不可考”，卻不敢提袁可立的“奴酋逆天順犯，於今七載。賴毛帥倡義，屢獲奇捷，大張撻伐之氣。據所報功級解驗，前後大小三十餘戰，斬首共一千九十七級數逾，上捷者共五次，總獲器械、弓箭等件共五萬”，袁崇煥一生斬首也沒超過一千多，更別提敵還遺落武器裝備五萬件。相比之下袁吹子們的廣渠門，戰場乾淨到什麼程度，屍體搶不到更撿不到敵器械！

甚至袁自己也曾點檢過，孫承宗上奏的“臣接平遼總兵毛文龍呈解屢獲首虜，隨行關外道袁崇煥逐一查驗三次，首級三百七十一顆，俱系真正壯夷，當陣生擒虜賊四名，俱系真正韃虜”。以至於丁卯北韓之役，登萊巡撫李嵩還奏報過500多的首級。

登撫武之望疏奏雲：“查各邊鎮臨陣擒斬，絕無有解獻入京者。即有之亦其首惡頭目，如寧夏之哱劉、重慶之樊虎、兗州之徐鴻儒等，其餘孽小丑悉於彼處正法，未有累累相屬致之於闕下者。至於斬獲首級，例行巡按、御史勘驗而已，亦未有禾□歲惡髑髏入都門而塵睿覽者。唯該鎮一解再解，以至踵解不已。不知解一番功級費一番資斧……（後面懶得斷句了）”——《明熹宗實錄》，天啟五年十二月。

除了首級外還有獻俘，登萊巡撫武之望的“一解再解，以至踵解不已”，朝臣們不是喜歡打嘴炮說毛文龍冒功嗎？毛文龍乾脆把活的俘虜全解遞給你們看，結果武之望苦不堪言，又抱怨是浪費民力和資源。獻首級吧，你們又說是殺良冒功，反正怎麼毛文龍都是錯！

再說說後金軍中原本有漢軍戶（原本每20漢戶供養一漢軍），但老奴殺“富戶”又殺“窮戶”，此後皇協軍數量被裁撤很多，但依然還存在一些，比如劉興祚劉興治等劉氏兄弟，還有李永芳等，就是這些皇協軍的代表。此外丁卯北韓之役時，也有李適之亂的餘孽韓潤以及薩爾滸投降的北韓元帥姜弘立當了帶路黨。難道這些皇協軍不能殺？！按此邏輯，抗戰時的那些二狗子都是好人，什麼汪精衛、陳公博都是天字第一類好人。

平遼總兵官毛文龍報稱：“參將易承惠等至咸寧營（威寧營）殺賊，林茂春等至海州城下攻城，各有斬獲共活擒真夷一十五名、夷級一十八顆，挐獲奸細馬承林等系李永芳兒女親家。又查在陣炮死官馬四十五匹、陣亡官兵李樸等三百一十四名、著傷官兵五十六名，並接回鄉難民汪仲舉等五千三十餘名。

薊遼總督閻鳴泰疏言：“……至於毛文龍塘報一事尤為可異，據其所稱攻掠海州者正月二十二日也，此正奴酋攻圍寧遠之日。海州去三岔河僅六十里，既雲火炮連天、喊聲動地，何奴中寂無一聞，而按兵逍遙若無事而回，獨不畏其掣也？”——《明熹宗實錄》，六年四月

據毛文龍奏報，寧遠之戰時兵分幾路攻打威寧營、海州等地。在《東江塘報》的詳細報告中，還在瀋陽附近放火。其中，還活捉了李永芳兒女親家的馬承林（親家兄弟），這個馬承林曾在遼陽陷落前潛伏於城中，裡應外合打開了城門。而閻鳴泰卻腦殘的表示懷疑，為什麼說腦殘了？因為不管是閻鳴泰還是袁大吹都沒有能力在後金按插奸細，後金什麼動靜兩人怎麼可能知道？還是吹子們給他們賦予“千里眼”還是“順風耳”？有這些本事，袁大吹也不用派喇嘛去驗證老奴是否死透了。後金大軍“按兵逍遙若無事而回”撤退有序，要是撤退秩序混亂，老奴帶兵那麼多年白帶兵了。

在後金的《清太祖實錄》中，先是“大兵將至右屯衛，守城參將周守廉率軍民已遁。帝令八官領步兵四萬，將海岸糧俱運貯右屯衛”，老奴派兵將袁大吹抗命不撤而沒來得及轉移的糧草辛辛苦苦搬回右屯，接著“二十七日，帝回至右屯衛，將糧草盡焚之”，老奴傻了嗎——居然把辛苦搬回右屯的糧草全部燒了！其實也驗證了，毛文龍的偷襲下，老奴趕緊率師而歸，連繳獲的糧草都顧不上——怕影響大軍行軍速度。就有吹子們懷疑不可能偷襲海州，其實海州就在鞍山驛往南一點，毛文龍幾個月後在老奴親征蒙古時能偷襲鞍山——同樣也能從陸路偷襲海州。

平遼總兵毛文龍揭報：“北韓李暉（光海君）之逆黨李適、韓明璉等起兵昌城，直奔王京。臣知統兵躡其後，遂爾被擒，其餘孽韓潤、鄭梅等竄入東夷求報父仇，稱“有左議政府尹義立者，約為內應。入貢天朝，謀寶玩以獻奴，傳令以今冬大舉犯鮮”。臣已移諮國王四面防守，暫移鐵山之眾就雲從島，柴薪期免守土之責。”

登撫武之望奏曰：毛帥駐師東江，所倚藉者，北韓耳。邇因遼人之耕牧漸廣，侵掠漸甚，鮮人厭苦之，所云李適等之叛主、韓潤等之勾奴與奴之將發兵以襲鐵山也，臣等微聞之而未敢信焉。第毛帥自五月以來，營室於須彌，所稱雲從島是也。今十月又盡徙兵民商賈以實之，而鐵山之地遂空矣。……——《明熹宗實錄》，天啟五年十二月初四

袁吹子不要臉的吹毛文龍是丁卯之役“轉進敗逃雲從島”，其實自李適之亂後，毛文龍就逐漸從鐵山轉移至雲從島，鐵山只剩老弱屯田。而李適之亂北逃的韓潤，一直勸說後金出兵，還對薩爾滸投降的北韓元帥姜弘立撒謊，說姜全家被新君仁祖殺害。在丁卯之役時，後金大軍攻破鐵山後，立即轉往攻打雲從島，而云從島距離海岸大約二三里。在一年前的寧遠之戰中後金大軍登上覺華島，現在卻登不上雲從島，被毛文龍率軍抵抗，而毛氏“黑龍”（龍捲風）正是這個時候發生，北韓記載“毛將自氷合後, 駐雲從島, 賊兵不得入”。因攻打不下雲從島後金轉而攻打北韓。雲從島可不是寧遠那樣，有朝廷的專款用於建築堅城。

就糧餉而言，毛文龍基本從未充足過，“六七年來只受國家銀一百五萬兩，米九十餘萬石”，這點到手的銀連關寧軍一年餉銀的一半都不到，糧和關寧軍一年開支（不算豆料）差不多。打仗就是打後勤，要的就是兵精糧足。毛文龍兵還不一定精，但糧絕對是不足的。糧餉不足，連後勤供應也未必充足，比如“兵部尚書王永光覆袁崇煥疏言:毛帥與北韓近,與奴酋遠。姑留以為虛聲,所請各項軍需,如鉛子、火藥、銀五萬兩急需也,宜半與之”。

就這樣的狀態下，據載毛文龍前後救濟接納上百萬逃民，其中大部分逃民透過登萊按插內地，有部分被選為兵丁，這些逃民也是要吃飯的。在崇禎年，東江狀況日益惡化，先是朝廷砍了東江的兵額，後是定餉東江軍士月錢七錢，再接著以東江冒餉(既然只有二萬八，那今年就是多領了）為由從第二年中扣除。因此在崇禎年，東江的牽制力也越發薄弱。

或許迫於糧餉等補給問題，毛文龍並沒有表現出一流的名將能力，但就事而論這才是“忠於事”，比袁大吹那種整日誇誇其談、白日做夢的更有功績也更盡職。

至於袁大吹殺毛文龍，說白了就是要毛文龍移鎮到遼南靠近後金去吸引後金火力天天硬扛，這樣袁大吹可以放心大膽的過大淩河築城，不用再害怕後金來強拆（寧錦之戰）！這就是搞笑的，大糧大餉的關寧軍自己不能過大淩河去扛，卻指望著東江窮鬼自我犧牲來換取時間。

為實現此“偽大”戰略，天啟六年袁大吹上奏要求毛文龍移鎮，結果被明熹宗否決，“得旨:疏說地勢人心極明,不必移駐”。第一次賊心不死的袁大吹居然派出了自己的狗腿子徐敷奏和趙佑，以共商軍事為名，數十艘船沿途停靠東江各口岸，以“（關寧軍）大糧、大餉、不見敵”誘惑招搖吃不飽穿不暖又經常外出殺敵的東江軍士叛逃，以此削弱東江實力，甚至還妄圖進入北韓（北韓事務一向由東江和登萊巡撫負責）。趙佑被當場格殺，徐敷奏逃竄回關寧。丁卯之役時東江數名將領欲趁機逃亡關寧不遂，共言與徐敷奏“有約”，因此再提前事，徐敷奏被下旨處死，但在寧錦之戰被袁大吹以“守城”為名抗旨。

第二次賊心不死的袁大吹，在寧錦兵變平息後，開始著手設計毛文龍。先是改東江餉司於關寧，無袁手令不得發餉；又搞海禁，禁止明商前往皮島；接著改北韓貢道於關寧（以前是從登萊到京城，海路短風險小），插手北韓事務打擊毛文龍對北韓的影響。以此掐斷東江經濟命脈以脅迫毛文龍。在文官和袁大吹的聯合絞殺下，東江日益窘迫，毛文龍不得不到登萊帶兵索餉。在斬殺毛文龍後，因欲移鎮故在東江“擬設馬兵營十營”。

最後徐敷奏與另一殺良劫財冒功的狗腿子張斌良逍遙法外，結果被梁廷棟告到崇禎面前要求與袁大吹同斬，徹底鬧大才捂不住。