人體組織結構從上到下，從外到內，都可以分出陰陽，就連皮肉筋骨與內臟經絡之間仍有陰陽之分，人體各個結構之間都存在著一定的陰陽對立的關係。 如果以陰陽來概括人體的身體結構，那麼就可以用陰陽標示來表示實體之間的概念在醫學中的應用。人體無論是臟腑、筋骨或皮肉，都是人體內的實體物質。在很早的時候，人們就用陰陽來表示天、地、日、月等是他，那麼仍然可以用類似的方法來標示人體內臟腑等其他實體結構。《素問五藏別論》中曾這樣說過：“腦、髓、骨、脈、膽、女子胞，此六者，地氣之所生也，皆藏於陰而象於地，故藏而不瀉，命曰奇恆之府。夫胃大腸小腸三焦膀胱，此五者，天氣之所生也，其氣象天，故瀉而不藏。”就是說，這六個奇恆的臟腑與地是屬於同一類的，都是屬於陰性；而五個腑是與天同一類，自然屬於陽性。這是根據它們這些器官所在的位置及內外分的，也可以根據它們自身的功能屬性來分，並不是採取同一個層次的統一標準。就如上面所說的心臟與肺臟一樣，心屬於陽性，肺則屬於陰性，這是根據它們自身的功能來確定陰陽的；心臟是主血脈，主要用於“溫通”，用於維持人體的恆定體溫，這與四季中的夏季也是相通的，所以也屬於陽性；肺臟清肅，這與四季中的秋季相通呼應，所以肺臟是屬於陰性的。但從這兩個臟器所在人體的位置來看，心臟在肺臟的下面，如果按照以上為陽，以下為陰的標準，心臟應該屬於陰性而肺部則為陽性。然而，從人體臟腑的形態與功能特性的角度來說，中醫是更注重其功能，所以說心是屬陽性，肺則為陰性。