1、增值稅發票超過90天沒有認證，進項稅不能抵扣，直接將進項稅計入材料成本中就可以了。（1）購進時帳務處理借：原材料（或庫存商品）借：應交稅金--增值稅（進項稅額）貸：銀行存款（2）過期未認證，做進項稅轉出憑證借：原材料（或庫存商品）貸：應交稅金--增值稅（進項稅轉出）2、如果按稅務說的作丟失處理，看看下面規定是否可行。已開具的增值稅專用發票丟失，按照國稅發（2006）156號檔案第28條規定辦理： 第二十八條 一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯和抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯影印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》（附件5），經購買方主管稅務機關稽核同意後，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證；如果丟失前未認證的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯影印件到主管稅務機關進行認證，認證相符的憑該專用發票記賬聯影印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》，經購買方主管稅務機關稽核同意後，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。 一般納稅人丟失已開具專用發票的抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，可使用專用發票發票聯影印件留存備查；如果丟失前未認證的，可使用專用發票發票聯到主管稅務機關認證，專用發票發票聯影印件留存備查。 一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯，可將專用發票抵扣聯作為記賬憑證，專用發票抵扣聯影印件留存備查。