鯨目可分為兩個子目：Mysticeti - 鬚鯨 - 和 Odontoceti - 齒鯨。　　現存種可分為鬚鯨亞目和齒鯨亞目。　　鬚鯨亞目 Mysticeti　　鬚鯨包含了世界上最大的現存動物種類。有3科10種，均為海棲。　　露脊鯨科 Balaenidae 如：黑露脊鯨（黑真鯨）Eubalaena glacialis、南露脊鯨Eubalaena australis、北極露脊鯨（弓背鯨）Balaena mysticetus、小露脊鯨Caperea marginata、露脊鯨（注：有的分為小露脊鯨科 Neobalaenidae）　　灰鯨科 Eschrichtiidae 如：灰鯨Eschrichtius robustus　　鬚鯨科 Balaenopteridae 如：藍鯨（藍鰮鯨，剃刀鯨）Balaenoptera musculus、小鬚鯨（小鰮鯨）Balaenoptera acutorostrata、座頭鯨（駝背鯨，大翅鯨）Megaptera novaeangliae、長鬚鯨 Fin whale、大鬚鯨（鰮鯨）、布氏鯨（鯷鯨） Bryde"s whale、小布氏鯨Balaenoptera edeni、塞鯨 Sei whale　　體型巨大，其中最小的種類體長也大於6米。口內無齒。上頜兩側各具有150～400枚角質鯨鬚。鯨鬚的顏色、數目和形狀因種而異，是分類的重要依據。外鼻孔2個，位於頭頂。頭極大，有的種可達體長的1/3。僅有1～2對肋骨與小型胸骨相連線，無鎖骨，鰭肢一般4指。具有盲腸。它們使用鯨鬚從海水中過濾浮游生物。以磷蝦和頭足類為食，有的也吃小魚和底棲貝類。　　齒鯨亞目 Odontoceti　　齒鯨僅少數種類生於淡水，大多數均產于海洋中。共包括7科80餘種。（注：齒鯨亞目得分科有一定的不同意見，大體可以分成海豚、喙鯨和抹香鯨三個差異比較大的類群，每個類群下分一至多科。）　　河豚科 Platanistidae 又稱淡水豚科。如：白鰭豚（白鱀豚）Lipotes vexillifer、印度河豚Platanista indi、恆河豚Platanista gangetica、亞馬孫河豚Inia geoffrensis、馬德拉河豚Inia boliviensis、拉普拉塔河豚Pontoporia blainvillei。　　海豚科 Delphinidae 如：真海豚 Delphinus delphis、短喙真海豚Delphinus delphis Linnaeus、長喙真海豚 Delphinus capensis Gray、寬吻海豚Tursiops truncatus、亞馬孫白海豚Sotalia fluviatilis、逆戟鯨（虎鯨、殺人鯨）Orcinus orca、海豚、中華白海豚、巨頭鯨（領航鯨、黑圓頭鯨）Globicephala melaena、大吻領航鯨、長肢領航鯨、短肢領航鯨、瓜頭鯨、北極虎鯨、偽虎鯨 Pseudorca crassidens 、侏虎鯨。（注：有的分為領航鯨科 Globiphlidae)　　鼠海豚科 Phocaenidae 如：江豚Neophocaena phocaenoides　　一角鯨科 Monodontidae 如：一角鯨（獨角鯨、角鯨）Monodon monoceros、白鯨Delphinapterus leucas，（注：有時伊河豚（短吻海豚）Orcaella brevirostris也歸入此科。）　　喙鯨科 Hyperoodontidae 如：布氏長喙鯨Mesoplodon densirostris　　抹香鯨科 Physeteridae 如：抹香鯨Physeter catodon　　小抹香鯨科 Kogiidae 如：小抹香鯨Kogia breviceps、倭抹香鯨Kogiasimus　　體型大小不一。口內有齒，外鼻孔僅有1個。鰭肢一般5指。除恆河豚外，均無盲腸。這種動物有獨特的透過回聲定位感知環境的能力。主要以烏賊、魷魚、甲殼類、魚類為食。