提問
Kozak序列和sd序列定義區別即定義
SD序列(Shine-Dalgarno sequence):mRNA中用於結合原核生物核糖體的序列.
SD序列:在細菌mRNA 起始密碼子AUG上游10個鹼基左右處,有一段富含嘌呤的鹼基序列,能與細菌16SrRNA3’端識別,幫助從起始AUG處開始翻譯.在原核生物中,核糖體中與mRNA結合位點位於16S rRNA 的3’端,mRNA中與核糖體16S rRNA結合的序列稱為SD序列(SD sequence),它是1974年由J.Shine 和 L.Dalgarno發現的,故此而命名.SD序列是mRNA中5’端富含嘌呤的短核苷酸序列,一般位於mRNA的起始密碼AUG的上游3至11個核苷酸處,並且同16S rRNA 3’端的序列互補.
所謂Kozak規則,即第一個ATG側翼序列的鹼基分佈所滿足的統計規律,若將第一個ATG中的鹼基A,T,G分別標為1,2,3位,則Kozak規則可描述如下:
(1)第4位的偏好鹼基為G;
(2)ATG的5’端約15bp範圍的側翼序列內不含鹼基T;
(3)在-3,-6和-9位置,G是偏好鹼基;
(4)除-3,-6和-9位,在整個側翼序列區,C是偏好鹼基.
Kozak規則是基於已知資料的統計結果,不見得必須全部滿足,一般來說,滿足前兩項即可
提問
Kozak序列和sd序列定義區別即定義
SD序列(Shine-Dalgarno sequence):mRNA中用於結合原核生物核糖體的序列.
SD序列:在細菌mRNA 起始密碼子AUG上游10個鹼基左右處,有一段富含嘌呤的鹼基序列,能與細菌16SrRNA3’端識別,幫助從起始AUG處開始翻譯.在原核生物中,核糖體中與mRNA結合位點位於16S rRNA 的3’端,mRNA中與核糖體16S rRNA結合的序列稱為SD序列(SD sequence),它是1974年由J.Shine 和 L.Dalgarno發現的,故此而命名.SD序列是mRNA中5’端富含嘌呤的短核苷酸序列,一般位於mRNA的起始密碼AUG的上游3至11個核苷酸處,並且同16S rRNA 3’端的序列互補.
所謂Kozak規則,即第一個ATG側翼序列的鹼基分佈所滿足的統計規律,若將第一個ATG中的鹼基A,T,G分別標為1,2,3位,則Kozak規則可描述如下:
(1)第4位的偏好鹼基為G;
(2)ATG的5’端約15bp範圍的側翼序列內不含鹼基T;
(3)在-3,-6和-9位置,G是偏好鹼基;
(4)除-3,-6和-9位,在整個側翼序列區,C是偏好鹼基.
Kozak規則是基於已知資料的統計結果,不見得必須全部滿足,一般來說,滿足前兩項即可