一、區別

1、實施動因不同

棚戶區改造從根本上講，是一項民生工程，目的是要解決住房條件最困難的那部分群眾的住房問題，為了消除該區域住房安全隱患，完善配套設施，改善居民生活條件。

房屋徵收則是為了實現某特定公共利益，如：建公立學校，修軍用機場等。儘管棚戶區改造具有公共利益特性，但它只是公共利益中的一種型別，是《徵補條例》第八條規定的公共利益情形之一，而不能涵蓋全部公共利益範疇。

2、處置物件不同

棚戶區改造針對的是簡易房、危房、舊房，通常以住房居多。而徵收時，不受被徵收房屋現狀和用途限制，既可以是危舊房，也可以是新房，不管是住房，還是寫字樓、商鋪、廠房，甚至養殖用房，只要是公共利益之需，都可以納入徵收拆除範圍。

棚戶區改造可以針對國有土地上房屋和集體土地上房屋，而《徵補條例》只能針對國有土地上房屋實施徵收。

3、處理方式不同

棚改，棚改，意味著以改造為主，拆除為輔。

棚戶區改造方式是多樣化的，包括修繕加固、改建(擴建、翻建) 和拆除新建，拆舊建新是不得以而為之的方式。

二補償標準不一樣

房屋徵收賠償標準適用於《土地管理法》

第四十七條 徵收土地的，按照被徵收土地的原用途給予補償。

徵收耕地的補償費用包括土地補償費、安置補助費以及地上附著物和青苗的補償費。徵收耕地的土地補償費，為該耕地被徵收前三年平均年產值的六至十倍。徵收耕地的安置補助費，按照需要安置的農業人口數計算。

需要安置的農業人口數，按照被徵收的耕地數量除以徵地前被徵收單位平均每人佔有耕地的數量計算。每一個需要安置的農業人口的安置補助費標準，為該耕地被徵收前三年平均年產值的四至六倍。但是，每公頃被徵收耕地的安置補助費，最高不得超過被徵收前三年平均年產值的十五倍。

徵收其他土地的土地補償費和安置補助費標準，由省、自治區、直轄市參照徵收耕地的土地補償費和安置補助費的標準規定。

被徵收土地上的附著物和青苗的補償標準，由省、自治區、直轄市規定。徵收城市郊區的菜地，用地單位應當按照國家有關規定繳納新菜地開發建設基金。

依照本條第二款的規定支付土地補償費和安置補助費，尚不能使需要安置的農民保持原有生活水平的，經省、自治區、直轄市人民政府批准，可以增加安置補助費。但是，土地補償費和安置補助費的總和不得超過土地被徵收前三年平均年產值的三十倍。

國務院根據社會、經濟發展水平，在特殊情況下，可以提高徵收耕地的土地補償費和安置補助費的標準

而對於棚改區，因為其屬於國有土地，所以適用於《國有土地上房屋徵收與補償條例》的相關規定。

棚戶區補償則是根據《國有土地上房屋徵收與補償條例》第十九條的規定

對評估確定的被徵收房屋價值有異議的，可以向房地產價格評估機構申請複核評估。對複核結果有異議的，可以向房地產價格評估專家委員會申請鑑定。

房屋徵收評估辦法由國務院住房城鄉建設主管部門制定，制定過程中，應當向社會公開徵求意見。

《國務院關於加快棚戶區改造工作的意見》（國發〔2013〕25 號）中將棚戶區改造分為了四類：城市棚戶區改造、國有工礦棚戶區改造、國有林區棚戶區改造、國有墾區危房改造。各地方應該按照意見的規定嚴格執行，不應隨意擴大棚戶區改造範圍。特別應該注意的是意見中並不包含集體土地。

棚戶區改造可以有效地解決低收入家庭的住房困難，體現社會公平、公正;可以提升和完善城市功能，改善城區落後面貌;可以最佳化配置土地資源，促進土地合理利用;可以增加社會就業，促進地區的產業結構調整;可以密切黨與居民群眾的感情，促進社會和諧