應付職工薪酬審計是對涉及應付職工薪酬專案進行審計，如應付職工薪酬與其他業務發生錯誤或舞弊行為，如虛報冒領、重複支付和貪汙等。同時，職工薪酬有時是構成企業成本費用的重要專案，所以在審計中便顯得十分重要。 　　應付職工薪酬的實質性程式通常包括： 　　（一）獲取或編制應付職工薪酬明細表,複核加計是否正確,並與報表數、總賬數和明細賬合計數核對是否相符。 　　（二）實施實質性分析程式： 　　1．針對已識別需要運用分析程式的有關專案，並基於對被審計單位及其環境的瞭解，透過進行以下比較，同時考慮有關資料間關係的影響，以建立有關資料的期望值： 　　(1)比較被審計單位員工人數的變動情況，檢查被審計單位各部門各月工資費用的發生額是否有異常波動，若有，則查明波動原因是否合理； 　　(2)比較本期與上期工資費用總額，要求被審計單位解釋其增減變動原因，或取得公司管理當局關於員工工資標準的決議； 　　(3)結合員工社保繳納情況，明確被審計單位員工範圍，檢查是否與關聯公司員工工資混淆列支； 　　(4)核對下列相互獨立部門的相關資料： 　　①工資部門記錄的工資支出與出納記錄的工資支付數； 　　②工資部門記錄的工時與生產部門記錄的工時。 　　(5)比較本期應付職工薪酬餘額與上期應付職工薪酬餘額，是否有異常變動。 　　2．確定可接受的差異額； 　　3．將實際的情況與期望值相比較，識別需要進一步調查的差異； 　　4．如果其差額超過可接受的差異額，調查並獲取充分的解釋和恰當的佐證審計證據（如透過檢查相關的憑證）； 　　5．評估分析程式的測試結果。 　　（三）檢查工資、獎金、津貼和補貼： 　　1．計提是否正確，依據是否充分，將執行的工資標準與有關規定核對，並對工資總額進行測試；被審計單位如果實行工效掛鉤的，應取得有關主管部門確認的效益工資發放額認定證明，結合有關合同文件和實際完成的指標，檢查其計提額是否正確，是否應作納稅調整； 　　2．檢查分配方法與上年是否一致，除因解除與職工的勞動關係給予的補償直接計入管理費用外，被審計單位是否根據職工提供服務的受益物件，分別下列情況進行處理： 　　(1)應由生產產品、提供勞務負擔的職工薪酬，計入產品成本或勞務成本； 　　(2)應由在建工程、無形資產負擔的職工薪酬，計入建造固定資產或無形資產； 　　(3)作為外商投資企業，按規定從淨利潤中提取的職工獎勵及福利基金，是否相應計入“利潤分配——提取的職工獎勵及福利基金”科目； 　　(4)其他職工薪酬，計入當期損益； 　　3．檢查發放金額是否正確，代扣的款項及其金額是否正確； 　　4．檢查是否存在屬於拖欠性質的職工薪酬，並瞭解拖欠的原因。 　　（四）檢查社會保險費（包括醫療、養老、失業、工傷、生育保險費）、住房公積金、工會經費和職工教育經費等計提(分配)和支付(或使用)的會計處理是否正確，依據是否充分。 　　（五）檢查辭退福利下列專案: 　　（六）檢查非貨幣性福利： 　　（七）檢查以現金與職工結算的股份支付： 　　（八）檢查應付職工薪酬的期後付款情況，並關注在資產負債表日至財務報表批准報出日之間，是否有確鑿證據表明需要調整資產負債表日原確認的應付職工薪酬事項。 　　（九）檢查應付職工薪酬是否已按照企業會計準則的規定在財務報表中作出恰當的列報。