1、多因培養料鹼性或酸性過高，目前各地黑木耳制種時，培養基中普遍加入麥麩作營養料。因此麥麩在各地銷售量較大，而且價格較高。致使重多銷售商為了利益在麥麩加入了大量石灰粉（重量提高）。所以使配製後的培養基鹼性嚴重過高，致使接入的菌種不萌發或不吃料。另因各地銷售的白灰假的很多（PH值只有4左右），如選用了這種白灰拌料，致使酸性偏低，加之蒸鍋滅菌前期升溫時間較長而加速酸敗。因此，使接入的菌種不萌發或不吃料。另因接種時袋內料溫過高，菌齡過長，造成菌種退化失去活力。

2、多因培養料水分偏幹（特別顆粒培養料內部水分沒有浸透），蒸鍋熟化程度沒有達到，接種後，易出現細菌感染並抑制菌絲萌發及生長。又因原種本身水分偏幹，生命力減退，加之栽培種培養基水分偏幹，接種後，急速吸收原種水分，使接入的菌種或菌絲造成乾枯致死。

3、多因培養料酸敗，目前，各地銷售的白灰出現了假的較多（PH值只有4左右），如選用了這種白灰拌料，配料時pH值嚴重偏酸，加之蒸鍋滅菌前期升溫時間較長而加速培養基酸敗。當pH值在3.5以下時，黑木耳菌絲就無法吃料。表現菌種塊萌發白色菌絲，僅往料面滲透性地吃料，但不能蔓延，並逐漸死亡。

4、多因存在殺菌物質，培養料中含有杉、松、樟等有殺菌作用的酵、脂、醚、甲醛類有害物質，直接影響了菌絲吃料，無法正常舒展蔓延。另培養料中為防止雜菌加入了多菌靈等藥物，致使菌種不能萌發。或加入了其它化學藥品及營養劑，產生了有害的化學反應，抑制菌絲萌發或吃料。