第一部描述書生寧採臣到蘭若寺躲雨，為道士燕赤霞所拒。夜半，被少女聶小倩美妙琴音吸引，兩人自此交往甚密。不料小倩乃樹精姥姥所操縱的女鬼，正在尋找壯男吸取陽精。燕赤霞義助寧採臣對付姥姥，並玉成他們這對人鬼戀人

第二部是第一集的延續，主線仍沿著主角寧採臣發展。故事發生於一個朝政混亂、民生困苦的朝代，寧採臣助小倩轉世，又與燕赤霞分手後，無辜被誣陷入獄。幸得通天博士諸葛臥龍相助，逃獄成功後來更與鬼馬道士知秋一葉因誤會以至相交，並投宿於一荒廢山莊。原來這山莊盡是忠義之士，在俠女傅青風及其妹傅月池的帶領下，準備營救他們被誣陷入獄的父親傅天仇。寧採臣發覺傅青風容貌酷似舊愛小倩，以為是小倩投胎，遂留下試探，怎料竟墮進一段三角戀愛中。將軍左千戶此時正押解傅天仇到山莊附近，其實左千戶也是一為愛國志士。他提議眾人求助於護法國師，豈料這國師實為妖精化身！寧採臣與傅青風幾經辛苦到蘭若寺尋得燕赤霞相助，正邪之間遂展開一場生死大戰

第三部小和尚十方隨師父白雲護送金佛，在蘭若寺遇到女鬼小卓與小蝶。十方放走小卓，但白雲卻被姥姥所擒。姥姥逼小卓嫁給黑山老妖，小卓向十方求助，十方掘出小卓骸骨逃出蘭若寺，並在劍俠燕赤霞的幫助下救出師父。在鬥法中燕與白雲合力消滅了姥姥，但此時黑山老妖用黑雲遮天，欲將其一網打盡。十方唯有化成佛祖金身，由小卓帶著飛上天空接太陽純陽之氣，藉以消滅老妖。

1.講的是寧採臣和小倩想事相知相愛，最後一起應對姥姥的故事，最後小倩犧牲了。

2.講的是過了好多年寧採臣一個人流浪江湖，最後和聶小倩長相一樣，以為他是小倩轉世，發生的情感糾纏。

3講的是小和尚十方和女鬼小卓的故事，小卓做了十方打敗反派差點犧牲，最後十方帶走小卓的骨灰，這樣小卓就可以一直陪著他。