基於第二代高通量測序技術，對於有參考序列的物種，針對不同的真菌菌株，可透過全基因組重測序的方法獲得全基因組範圍內完整的變異資訊，討論群體的遺傳結構、影響群體遺傳平衡的因素以及物種形成的機制，定位重要性狀位點，為後續分子育種打下堅實基礎。同時，透過全基因組大樣本重測序對真菌重要菌株進行全基因組的基因型鑑定，並與關注的表型資料進行全基因組關聯分析（GWAS），找出與關注表型相關的SNP位點，定位性狀相關基因。隨著測序成本降低和擁有參考基因組序列的物種增多，基因組重測序也成為育種研究中迅速有效的方法之一，在全基因組水平掃描並檢測出與重要性狀相關的變異位點，具有重大的科研價值和產業價值。
近日，Nature Genetics發表的一篇文章就充分利用了微生物基因組測序與以全基因組重測序為基礎的全基因組關聯分析結合的方法，揭示了裂殖酵母遺傳與表型多樣性之間的聯絡。研究者選取裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe作為研究物件，在全球20個國家範圍內收集了時間跨度為100年的161個野生株系的S.Pombe，進行了全基因組測序，推測裂殖酵母在公元前340年開始廣泛大量出現，祖先種到達美洲的時間為公園1623年。後續研究者又選取223個菌種進行全基因組關聯分析，發現至少89個性狀表現出一個關聯。每個性狀最顯著的檢測到的變異可以解釋平均22%的表型差異，且indel的影響比SNP更大。
基於第二代高通量測序技術，對於有參考序列的物種，針對不同的真菌菌株，可透過全基因組重測序的方法獲得全基因組範圍內完整的變異資訊，討論群體的遺傳結構、影響群體遺傳平衡的因素以及物種形成的機制，定位重要性狀位點，為後續分子育種打下堅實基礎。同時，透過全基因組大樣本重測序對真菌重要菌株進行全基因組的基因型鑑定，並與關注的表型資料進行全基因組關聯分析（GWAS），找出與關注表型相關的SNP位點，定位性狀相關基因。隨著測序成本降低和擁有參考基因組序列的物種增多，基因組重測序也成為育種研究中迅速有效的方法之一，在全基因組水平掃描並檢測出與重要性狀相關的變異位點，具有重大的科研價值和產業價值。
近日，Nature Genetics發表的一篇文章就充分利用了微生物基因組測序與以全基因組重測序為基礎的全基因組關聯分析結合的方法，揭示了裂殖酵母遺傳與表型多樣性之間的聯絡。研究者選取裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe作為研究物件，在全球20個國家範圍內收集了時間跨度為100年的161個野生株系的S.Pombe，進行了全基因組測序，推測裂殖酵母在公元前340年開始廣泛大量出現，祖先種到達美洲的時間為公園1623年。後續研究者又選取223個菌種進行全基因組關聯分析，發現至少89個性狀表現出一個關聯。每個性狀最顯著的檢測到的變異可以解釋平均22%的表型差異，且indel的影響比SNP更大。