1.本質上講這種約定實際上是對結算方式的約定，既以審計結論作為結算依據確定結算價格；

2.這種約定下，應該以具有資質的工程造價諮詢機構出具的報告作為結算依據，而不是以甲方自身的稽核結論為準；

3.即便是第三方機構出具的審價報告，乙方也有權提出異議。如果各方對異議無法達成一致意見的，可以就爭議部分透過司法鑑定解決；

4.及時進行結算是雙方應負的義務。即便在合同未約定結算時間條件的情況下，乙方仍可以督促甲方及時進行結算。否則，應對延誤期間所發生損失承擔賠償責任。

個人意見，供參考

審計後工程價款的95%，留5%保證金，這是建設工程施工合同的慣用條款。

發包人與承包人之間在建設工程施工合同中法律關係屬於平等主體之間的民事法律關係，審計和和接受審計必須有委託方和受託方的同意。當事人之所以要引入第三方機構進行結算審計，其目的是利用第三方的專業知識來彌補發包方在長程造價專業知識上的不足，將工程成本控制在合理範圍。

工程造價的委託審計應當區分為公權力機關依職權進行的委託和民事主體自主進行的委託。

即便施工方對於審計價格有疑議完全可以不簽字認可。

根據財政部、原設部印發的《建設工程價款結算暫行辦法》（財建[2004]369號)、《合同法》和《建設工程施工合同（示範文字）》的相關規定：工程竣工驗收合格後28天內，承包人向發包人遞交竣工結算報告及結算資料，發包人在收到承包人結算書後28天內進行稽核。

《合同法》第279條規定：“工程驗收合格的，發包人應當按照約定支付價款，並接收該建設工程。”

一般來說合同雙方的條款都不會很明確約定結算等責任方。尤其是甲方過於強勢的的單位，例如中字頭企業，像我公司就經常遇到這些問題，合同上條款大多甲方佔優勢，而且不得不以甲方 的模板為準，中字頭企業簽訂合同以及辦理結算都很慢，當前政策已經沒有硬性規定結算需要以審計稽核結果為準，都是雙方確認，很考究商務談判能力，並且一般情況下合同上都有約定期限，如果超過期限，又談不攏，可以尋求法律援助，像我們公司一般都是直接發函，效果會好很多。

首先，在一般的建設工程合同履行過程中，甲乙雙方均會對工程款的支付做分期約定，且一般因工程量大的原因，多數工程涉及審計。但您所說的這個合同條款，僅是對工程款支付條件的約定。至於您所提出的審計問題，雙方一般會另有約定，很多時候是交由專業的第三方審計機構出具審計報告，而非以單方審計結果為準，除非一方審計完成後另一方在合理期限內沒有提出異議。而關於您所提到的審計期限，審計機構也不會無端拖延。

5%為建設工程質量保證金。

應當在合同中約定返還保證金的期限。

沒有約定的，自建設工程透過竣工驗收之日起滿兩年。