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    細菌的啟動子包含幾個分散的序列,-35區,擴充套件的-10區,-10區,σ因子的識別區和由α亞基的羧基末端結構域識別的UP元件。所有的細菌都具有一個必需σ因子,稱為管家σ因子(例如大腸桿菌中的σ70;也被稱作RpoD ),它負責識別大多數啟動子(圖1b)。管家σ因子由4個結構域組成,這些結構域透過柔性linkers連線。在RNA聚合酶全酶中,σ因子結合在核心酶的亞基上,使得σ因子的每個結構域都與特定的啟動子元件相互作用。σ因子的結構域3和4主要作用是RNA聚合酶的最初定位,結構域1和2主要作用是促進開放複合物的形成。管家σ因子的另一個作用是透過結構域1調節的,它能確保DNA在RNA與啟動子結合之前不進入活性區域,當RNA聚合酶與啟動子結合後觸發構象的改變允許DNA進入活性區域。擴充套件資料啟動子功能變異的疾病:以下是從人類孟德爾遺傳學(OMIM)證實與啟動子故障有關,不論是因啟動子序列直接突變或是轉錄因子或轉錄共激發因子的突變。而多種癌症都沒有列下是因為從染色體易位產生嵌合基因:哮喘 β地中海貧血、魯賓斯坦泰比綜合症。要留意的是在病原學上大部份的疾病都是異質的,而在分子層面上一種疾病往往是指多種疾病,縱然它們的病徵及治療方法一致。疾病對治療有不同的反應,是因背後分子源頭的差異,這會是藥物遺傳學的範疇。

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