你問了一個複雜的問題，也是一個眾多化學工作者想知道的問題。單從反應這個大的方面來看，顏色由三方面影響:第一、反應物與產物本身的顏色。第二、反應生成的副產物和雜質導致的顏色。第三、反應所加入的催化劑和配體的顏色。這些說的還很籠統，但是你做一個化學反應時，面對顏色變化可以從這三方面入手，肯定會有幫助，要從更深層方面去了解的話，還要細說。

第一、反應物與產物本身的顏色。反應開始之前，你每加一種反應物，顏色都會變化，這是由於反應物本身可能就是有顏色的，然後各種顏色雜糅，顏色會不斷變化；反應過程中，各種含有顏色反應物的含量在不斷降低，生成物的濃度不斷增加，而生成物的顏色可能跟反應物顏色不一樣，所以表現出來的就是反應過程中體系的顏色是不斷變化的，如果反應很純，那麼反應體系的顏色應該是反應物雜糅的顏色逐漸向生成物單一顏色過度，所以有時候顏色的變化也可以作為判斷反應進度，甚至終點的參照。這是比較理想的情況。

第二、反應生成的副產物和雜質導致的顏色。化學反應有雜質和副產物生產是非常正常的；可以預測，並且能研究清楚結構，並且含量較高的非產品生成物，我們習慣叫副產物；那些成分複雜，分子量巨大，難以判斷結構，含量很低的非產品生成物，我們習慣叫雜質（色素）。

一般來說副產物雖然含量多，可能是雜質（色素）的幾百倍，上千倍，但是對顏色的影響可能遠不如雜質（色素）。雜質一般都是大分子，含有很多雜環，含氮很多，顏色很重。我們平常做反應時，看著體系黑不溜秋的，跟狗屎一樣，但是等你把產品純化出來後，產品是白色色或者是單純一種顏色，非常乾淨，就是因為雜質的影響。這種情況是非常普遍的。

第三、反應所加入的催化劑和配體的顏色。很多反應需要加入催化劑和配體才能有效的反應，這樣使得反應速率很快，並且反應很純。但是你會發現，你從監控看反應的話，是很純的，但是從肉眼看體系的話，就非常髒，跟汙水一樣。那是因為催化劑（參與反應，本身不反應，但是也會被破壞）在反應過程中被破壞了一部分，配體已經變成其他結構物質了，然後反應條件劇烈，色素非常多，導致了屎一般噁心的顏色，努力純化吧，產物還是很乾淨的。

化學反應中顏色的變化，取決於人類視網膜的接觸資訊。

人與蜜蜂看到的世界色彩截然不同。

1、感官上的顏色變化，取決於人類視網膜接受光波傳遞的訊號，也就是人眼可接收波長。

2、化學反應中，色彩的變化十分豐富，每一個色彩有不同強度的表現。人類如何區分色彩的強弱，是比較困難的。

3、加上多重顏色不同，相互混合而成的多重色彩交叉相互掩蓋，很難有一個標準的概念去定量描述。