水溫

對於硝化細菌而言，最合適生長的水溫是20～28℃，其中以25℃時，生長以及繁殖態勢最佳。通常水溫低於15℃或高於40℃，硝化細菌就停止了代謝和分解作用，而且水溫超過這個範圍，硝化細菌也很難存活。

光照

硝化細菌不像水草和水藻那樣需要進行光合作用合成有機物。它們不僅無法利用Sunny，甚至還懼怕Sunny的照射。

底質

硝化細菌對底質的要求非常高，水族箱內的良好底質能夠提供硝化細菌附著、遮掩和獲得氨源作用。當硝化細菌沒有找到合適的附著物時，就不會進行繁殖，也就更加不會分解氨了。一些過濾器材裡面，如過濾棉、生化海綿、玻璃環等，都是硝化細菌比較喜歡呆的地方。

水流

水族箱裡要保持水的對流性，因為硝化細菌選定落腳點後，就不會隨意更換地方，這時適當的水流，能夠為硝化細菌帶來氧氣、氨以及其他營養物質，對其生長極其有利。

水溶氧

硝化細菌的生長不能缺少溶氧。一般來說，建議水族箱內水溶氧的含量不要低於0.0002％，否則無法建立起所需的硝化系統。

消除其他競爭對手

有機物是硝化細菌生長的最大威脅者。其不但會影響硝化細菌的生長，還會直接引來異營性細菌，這時硝化細菌的生存空間就會遭到排擠，最後導致無法持續發展，要麼萎靡不振，要麼撤離家園移至他處。