主要區別如下： (1)適用的範圍不同，辦理託收承付的收款單位和付款單位必須是國有企業、供銷合作社以及經營管理較好，並經開戶銀行審查同意的城鄉集體所有制工業企業，而委託收款的收款人和付款人的範圍較廣，適用於在銀行開立賬戶的各種企業、經濟組織或者個人。

託收承付結算只適用於異地的款項結算，並且辦理計算的款項必須是商品交易以及因商品交易而產生的勞務供應的款項，代銷、寄銷、賒銷商品的款項不得辦理託收承付結算。而委託收款同城、異地均可以辦理，而且適用各種款項的結算，既適用於水電、郵電、電話等勞務款項的結算，也適用於單位和個人憑已經承兌的商業匯票、債券、存單等付款人債務證明辦理款項的結算。(2)辦理的程式不同，相對來說，委託收款的辦理程式比託收承付要簡便些。在託收承付結算方式下，收款單位根據經濟合同發貨後，委託銀行向異地付款單位收取款項，由付款單位按照經濟合同規定核對結算單證或驗貨後再向銀行承付款項。而委託收款結算方式是先由收款人向銀行提交委託收款憑證和有關債務證明並辦理委託收款的手續，銀行在接到寄來的委託收款憑證及債務證明，經審查無誤後再向收款人辦理付款的行為，付款人的開戶銀行應該經付款人授權後才能付款，付款人授權時應該填寫同城或者異地委託收款授權書，寫明銀行賬號和與收款人的合同號，並且加蓋單位的公章。