1、代謝因素： 　　（l）胱氨酸尿症：為先天性疾病，常以結石為主要臨床表現。

　　（2）草酸的代謝及異常：草酸為人體終末代謝產物，是形成含鈣結石的重要因素。原發性高草酸尿症是一種嚴重的遺傳性疾病，可分為：I型稱乙醇酸尿型，Ⅱ型稱左旋甘油酸尿型，均由於相應代謝酶缺乏所致，治療因難，尤其是H型；III型原發性高草酸尿症，該類病人由於腸道對鈣的吸收較正常人多，造成尿中草酸量增加。　　（3）鈣、磷代謝及其異常：人體鈣、磷代謝由甲狀旁腺激素、降鈣素、胰島素、前列腺素等激素調節，如果上述激素間平衡失調，則可能導致尿石形成。　　臨床上有一類尿石病人表現為尿鈣增高而原因不明，被稱為特發性高尿鈣。目前認為其原因有以下幾種：A。吸收性高尿鈣：最常見，此類病人腸道對鈣的吸收較正常人增加：B。腎性高尿鈣：此類病人腎對鈣的再吸收發生障礙：C。腎失磷性高尿鈣：此類病人由於原發性腎磷域低，腎小管漏出較多的磷，引起輕度低血磷，並繼發高尿鈣。　　（4）尿酸結石成石的危險因素：包括尿量、尿酸量、尿的Ⅺ因子等，與結石有關的是24小時尿中尿酸水平。　　2、服用與結石形成有關的藥物 　　（1）維生素D中毒：使腸道大量吸收鈣。　　（2）乳鹼綜合徵：由於尿PH增加，易於產生磷酸鈣結石。　　（3）皮質類圍醇：易產生高尿鈣和尿石症ε 　　（4）乙醯唑胺：可致尿PH增高，減弱抑制物活性。　　（5）磺胺類藥物：因在尿中溶解度低而易形成結石。　　（6）增加草酸排洩的藥物：維生素C、阿司匹林等。　　3、引起尿石症的後天疾病 　　（1）甲狀旁腺機能亢進：因導致溶骨性和腸吸收性高血鈣而致形成尿石。　　（2）制動綜合徵：由於截癱或外傷等原因引起長期臥床引起骨骼廢用性脫鈣而發生高尿鈣。　　（3）類肉瘤病：可能病人腸道對1，25—（OH）2的敏感性比正常人高，故鈣吸收增多。　　（4）皮質醇症：透過促進骨鈣釋出而引起高尿鈣。　　（5）各種伴有骨脫鈣的疾病。　　（6）腸大部分切除、腸吻合短路及慢性消化道疾病：由於草酸吸收過多引起高草酸尿。　　（7）增加腸鈣吸收的疾病。　　（8）痛風：因尿中尿酸增高而引發結石形成。　　（9）惡性腫瘤、白血病：因細胞破壞致尿酸增高而引發結石形成。