一般要求出院後一個月把病歷報銷資料送交給新農合，沒有嚴格的時間限制，不過不要出本年度，因為第二年重新籌資，需要重新參合，重新設定報銷方案，當年度不報，再報就麻煩了。

有時間限制，當年發生的醫療費原則上在次年的1月底前必須結清。報銷範圍：1、門診報銷：　　（1）村衛生室及村中心衛生室就診報銷60%，每次就診處方藥費限額10元，衛生院醫生臨時補液處方藥費限額50元。　　（2）鎮衛生院就診報銷40%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額100元。　　（3）二級醫院就診報銷30%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額200元。　　（4）三級醫院就診報銷20%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額200元。　　（5）中藥發票附上處方每貼限額1元。　　（6）鎮級合作醫療門診補償年限額5000元。

在省內看病的，只能報銷本年度內的，如果超過了一年是不給予報銷的。而在省外看病的，時間就更短了，6個月，也就是說你必須在6個月內報銷完，否則就會報銷不了。

參合農民在縣內定點醫療機構就診，不需辦理轉診手續，轉診到縣外定點醫療機構就診者，須持縣級定點醫療機構的診斷和轉診證明報縣合管辦審批，經批准登記並在出院10日內持有關證件到縣合管辦按照市級或市級以外就診執行補助，否則不予補助