腦控武器指的是透過物理、化學手段對人腦產生影響，從而影響人的心理、行為或產生幻覺幻聽效應的武器。通常的“腦控武器”指的是精神電子武器。腦控武器使用的物理手段有電磁輻射（如微波）、次聲波等。

腦控最早出現在神經科學領域，主要判斷大腦區域負責什麼動作，以及血液濃度。後來運用到武器領域，透過微博以及次聲波干擾人的行為，對人的生理和心理產生幻覺的作用。

每個人都有不同的腦電波，這就像指紋一樣世界上找不到具有兩片相同脈絡的葉子也找不到具有兩個相同頻率腦電波的人。腦控武器首先要做的是把採集到的腦電波特徵存入電腦之中，然後根據演算法將腦電波解譯。將腦電波訊號轉化成我們常用的語言感情等各種神經活動的訊號，透過影象或者是文字的方式顯示出來。

這樣的解譯過程是可逆的，既然技術手段可以將腦電波解譯成為文字和影象。那麼自然可以將所須要執行的任務或者是文字影象透過編碼的形式轉換成為腦電波，寫入人的大腦之中。這時候人大腦接收到腦電波的訊號和自然形成的訊號別無二樣，就會產生真實感。計算機可以控制的大腦活動區域幾乎囊括了人們所能感知到的方方面面，從飄渺不定的愛情到所能接觸的視覺聽覺以及嗅覺，甚至連夢境都是可以控制的。隨著技術手段的發展，慢慢就會演化成為這些可以被遠距離讀取和遙控的腦電波資訊，不需要向人體植入晶片了就可以遠距離操控人的思想和行為。

腦控武器正是基於這種技術手段，來進行行為上的控制或者精神上的折磨。被控制的人是這種科技手段的直接受害者，一般來講這種精神控制的受害者，十分隱蔽。目前的腦控技術可以做到竊聽，關於操控人行為方面尚不完善。