美軍駐日本的基地是二戰的產物，1945年日本戰敗，美國作為戰勝國全面佔領日本。1951年簽訂了《日美安全保障條約》。條約規定日本承認美國在日本駐紮陸海空軍，駐日美軍負責遠東和平與保障日本的安全。主要基地有:

第一，橫田、座間軍事基地。

橫田與座間是駐日美軍司令部所在地，其中橫田還是駐日美軍第五航空隊的司令部駐地。

座間是駐日美陸軍司令部和陸軍第九戰區支援司令部所在地，主要任務是為陸軍提供後勤支援。

第二，沖繩島基地。

是駐日美軍人數最多的地方，大約有2.8萬名現役官兵駐防，美軍現佔用該島18%的陸地面積。

基地面積佔全部駐日美軍全部基地的75%，在此的普田間等地建有各種軍事設施共39處。駐有70%的海軍和海軍陸戰隊。聽從美國第三海軍陸戰隊遠征軍司令部的指揮。

第三，橫須賀、佐世保基地。 橫須賀是駐日海軍艦隊基地司令部，是美在日本最主要的海軍基地，與日本海上自衛隊合用，是美海軍第七艦隊司令部所在地。第七艦隊的母港。“里根”號航空母艦駐這裡，另外8艘護衛艦隻也駐這裡。這裡還具備艦船維修保養設施及燃料和彈藥庫。

佐世保艦隊基地司令部作為美在日本的第二大海軍基地，是美軍駐日部隊的主要後勤保障基地。美第七艦隊的兩棲攻擊艦就住這裡。

另外，在日本的北部三澤，還建有一個駐日美軍的空軍基地。駐日美軍的飛行員大都住在那裡，或在那裡修養。