第一關：哥爾讚的反擊，出自迪迦奧特曼第18集。

第二關：移動要塞不能上升，出自戴拿奧特曼第25,26集。

第三關：嘲笑之眼，出自蓋亞奧特曼第6集。

第四關：高斯VS傑斯提斯，出自高斯奧特曼劇場版：最終決戰！高斯VS傑斯提斯。

第五關：怪獸殿下，出自初代奧特曼第26,27集。

第六關：MAC全滅！恐怖的圓盤生物！出自雷歐奧特曼第40集。

第七關：影之繼承者，出自迪迦奧特曼第44集。

第八關：黑暗的支配者，出自迪迦奧特曼第51,52集。

第九關：死鬥！戴拿VS戴拿，出自戴拿奧特曼第31集。

第十關：決戰之日，出自蓋亞奧特曼第26集。

第十一關：世界十大據點侵略指令。

不是奧特曼劇集，雜燴性質的一關。

第十二關：怪獸標本，出自初代奧特曼第28集。

第十三關：激鬥！80VS賽文，出自艾迪奧特曼第44集。

第十四關：恐怖的雷德王復活宣言，出自愛迪奧特曼第46集。

第十五關：再會，奧特曼，出自初代奧特曼第39集。

第十六關：奧特警備隊向西部挺進，出自賽文奧特曼第14,15集。

第十七關：兩大怪獸襲擊東京，出自傑克奧特曼第5集。

第十八關：死刑！奧特五兄弟，出自艾斯奧特曼第13,14集。

第十九關：奧特英雄榜，出自泰羅奧特曼第40集。

第二十關：大沉沒！日本的末日出自雷歐奧特曼第1集。

PS：以上順序是奧特曼格鬥進化3全部隱藏關卡出現後的順序。