基因工程在農業方面的應用是培養“超級植物”，或稱“轉基因植物”，其主要方向和取得的成果主要有：改良作物品種，提高作物產量；提高農作物的抗病能力；培養耐寒、耐旱、耐熱、耐鹽鹼特性的農作物，以擴大作物播種面積；提高農作物的蛋白質含量；使一般作物具有類似豆類作物一樣的固氮能力；使植物含有動物蛋白質；提高某些作物的光合作用能力。 基因工程在畜牧業方面的應用是培養“超級動物”，或稱“轉基因動物”，其主要方向有提高家畜、家禽的生長速度，減少飼料消耗；提高家畜的出肉率和瘦肉的比例；提高家畜、家禽的抗病能力；提高家畜的產奶率和家禽的產蛋率；培養新的家畜和家禽品種；培育某些家畜令其奶中含有藥物成分。 在醫學方面基因工程的應用是製造“超級藥物”以消除遺傳疾病及癌症、艾滋病一類絕症，其方向主要是採用基因重組技術，使人體恢復胰島素生產功能，根除糖尿病；製造抗癌藥物，使癌細胞轉化為正常細胞或消滅癌細胞，以根治癌症；培養防治艾滋病、肝病、小兒麻痺症等病症的疫苗；修改有缺陷基因，消除遺傳疾病；在水果或食用植物中轉移藥物基因，培育有免疫功能的水果。基因還可培養用於人體的動物器官。 基因工程應用於刑事鑑定科學，可製作基因指紋。基因指紋用於刑事鑑定的準確率遠高於傳統的指紋。而且只需獲得億分之一的取樣量就可進行，方便易得。親子基因的鑑定，還可使被拐騙兒童找到自己的親生父母。 基因工程還可應用於研究動植物的物種起源——科學家利用基因比較發現，鯨與牛的親緣關係比魚更接近；中國、美國、加拿大三國科學家透過基因研究宣佈鳥類起源於恐龍。 基因工程在其他領域的應用也很廣泛。美國科學家利用基因工程在山羊奶中煉出了“生物鋼”，他們將蜘蛛蛋白基因轉移到山羊的乳房細胞中，使山羊乳汁中產生蜘蛛蛋白，以此製造出一種嶄新的蜘蛛絲式纖維。這種纖維不僅可降解，而且其強度足以防彈。科學家們還一直試圖從恐龍化石中找到恐龍基因，希望由此復活已滅絕的恐龍。
基因工程在農業方面的應用是培養“超級植物”，或稱“轉基因植物”，其主要方向和取得的成果主要有：改良作物品種，提高作物產量；提高農作物的抗病能力；培養耐寒、耐旱、耐熱、耐鹽鹼特性的農作物，以擴大作物播種面積；提高農作物的蛋白質含量；使一般作物具有類似豆類作物一樣的固氮能力；使植物含有動物蛋白質；提高某些作物的光合作用能力。 基因工程在畜牧業方面的應用是培養“超級動物”，或稱“轉基因動物”，其主要方向有提高家畜、家禽的生長速度，減少飼料消耗；提高家畜的出肉率和瘦肉的比例；提高家畜、家禽的抗病能力；提高家畜的產奶率和家禽的產蛋率；培養新的家畜和家禽品種；培育某些家畜令其奶中含有藥物成分。 在醫學方面基因工程的應用是製造“超級藥物”以消除遺傳疾病及癌症、艾滋病一類絕症，其方向主要是採用基因重組技術，使人體恢復胰島素生產功能，根除糖尿病；製造抗癌藥物，使癌細胞轉化為正常細胞或消滅癌細胞，以根治癌症；培養防治艾滋病、肝病、小兒麻痺症等病症的疫苗；修改有缺陷基因，消除遺傳疾病；在水果或食用植物中轉移藥物基因，培育有免疫功能的水果。基因還可培養用於人體的動物器官。 基因工程應用於刑事鑑定科學，可製作基因指紋。基因指紋用於刑事鑑定的準確率遠高於傳統的指紋。而且只需獲得億分之一的取樣量就可進行，方便易得。親子基因的鑑定，還可使被拐騙兒童找到自己的親生父母。 基因工程還可應用於研究動植物的物種起源——科學家利用基因比較發現，鯨與牛的親緣關係比魚更接近；中國、美國、加拿大三國科學家透過基因研究宣佈鳥類起源於恐龍。 基因工程在其他領域的應用也很廣泛。美國科學家利用基因工程在山羊奶中煉出了“生物鋼”，他們將蜘蛛蛋白基因轉移到山羊的乳房細胞中，使山羊乳汁中產生蜘蛛蛋白，以此製造出一種嶄新的蜘蛛絲式纖維。這種纖維不僅可降解，而且其強度足以防彈。科學家們還一直試圖從恐龍化石中找到恐龍基因，希望由此復活已滅絕的恐龍。