Night Shift—— 在顯示與亮度介面，增加了冷暖螢幕調節（也就是螢幕色溫調節）功能，增加了“減弱藍光”的選項，可以在一定程度上減弱螢幕光對視力的傷害。[4] 在 Night Shift 模式下，將會減弱通常被裝置所忽略的藍光光線，從而阻止藍光對使用者的生物鐘造成影響。有研究指出，藍光正是導致產生數碼視覺疲勞的主要原因，因此透過減弱藍光在理論上就可以幫助使用者更好地入睡。值得注意的是，Night Shift 和蘋果的一些功能類似，對於裝置的硬體也是有要求的。已經有使用者發現，Night Shift 只支援 64 位處理器（A7 或更新的處理器）的 iPhone、iPod 和 iPad。[5] 備忘錄——增加備忘錄密碼保護功能，可以為備忘錄設定密碼，密保備忘錄只能在iOS9.3、OS X 10.11.4版本系統中可見。 蘋果新聞——新聞演算法進行改善，新加入了橫屏模式以及文章中影片播放； 健康——健康應用採用新介面，可以更輕鬆看到自己的步數、鍛鍊。在某些類別新加入選單方便使用者發現更多應用； CarPlay——CarPlay的Apple Music功能支援“為您甄選”和“新內容”功能，地圖新加入附近功能，可以定位附近的額餐館、咖啡廳； 教育——iOS 9.3包含多項新增的教育功能，比如學生分享iPad，全新課堂應用和蘋果學校管理等 。 Wi-Fi助理——蘋果在“Wi-Fi助理”開關處標識了使用期間所耗費的流量，明確告知使用者目前用了多少流量。再度關閉開啟功能即可重置統計使用Wi-Fi助理期間的耗費資料。 增強了系統內建App的3D Touch功能：包括設定、健康、指南針等App。 蜂窩資料選項做了修改。 安裝iOS 9.3 Beta1後，在WiFi環境下播放音樂半個小時，耗電量為10%，而在行動網路環境下，瀏覽網頁裝置就會快速發燙，同時電量消耗也更加快速。
Night Shift—— 在顯示與亮度介面，增加了冷暖螢幕調節（也就是螢幕色溫調節）功能，增加了“減弱藍光”的選項，可以在一定程度上減弱螢幕光對視力的傷害。[4] 在 Night Shift 模式下，將會減弱通常被裝置所忽略的藍光光線，從而阻止藍光對使用者的生物鐘造成影響。有研究指出，藍光正是導致產生數碼視覺疲勞的主要原因，因此透過減弱藍光在理論上就可以幫助使用者更好地入睡。值得注意的是，Night Shift 和蘋果的一些功能類似，對於裝置的硬體也是有要求的。已經有使用者發現，Night Shift 只支援 64 位處理器（A7 或更新的處理器）的 iPhone、iPod 和 iPad。[5] 備忘錄——增加備忘錄密碼保護功能，可以為備忘錄設定密碼，密保備忘錄只能在iOS9.3、OS X 10.11.4版本系統中可見。 蘋果新聞——新聞演算法進行改善，新加入了橫屏模式以及文章中影片播放； 健康——健康應用採用新介面，可以更輕鬆看到自己的步數、鍛鍊。在某些類別新加入選單方便使用者發現更多應用； CarPlay——CarPlay的Apple Music功能支援“為您甄選”和“新內容”功能，地圖新加入附近功能，可以定位附近的額餐館、咖啡廳； 教育——iOS 9.3包含多項新增的教育功能，比如學生分享iPad，全新課堂應用和蘋果學校管理等 。 Wi-Fi助理——蘋果在“Wi-Fi助理”開關處標識了使用期間所耗費的流量，明確告知使用者目前用了多少流量。再度關閉開啟功能即可重置統計使用Wi-Fi助理期間的耗費資料。 增強了系統內建App的3D Touch功能：包括設定、健康、指南針等App。 蜂窩資料選項做了修改。 安裝iOS 9.3 Beta1後，在WiFi環境下播放音樂半個小時，耗電量為10%，而在行動網路環境下，瀏覽網頁裝置就會快速發燙，同時電量消耗也更加快速。