原則之一是客觀性，專案評估是在專案主辦單位可行性研究的基礎上進行的再研究，其結論的得出完全建立在對大量的材料進行科學研究和分析的基礎之上。在評估實施過程中，既要對可行性研究報告的編制依據及全部資料進行查證核實，又要根據專案評估的內容和分析要求，深入企業和現場進行調查，以蒐集新的資料和材料，以專家的學識確保所有專案資料客觀詳實。同時專案評估涉及專案投資的工藝裝置、技術物資支援、財務分析以及未來市場預測等多個領域，評估人員必須以宏觀地理解和掌握相關學科知識為前提，客觀公正地評價和處理評估中的每一個細節，並在評估報告中客觀公正地表述出來。

原則之二是科學性。首先要有一個科學的態度。專案評估是專案建設前的一項決定性工作，它的任何失誤都可能給企業、給國家帶來不可估量的損失，因此評估人員必須持有對國家、對企業高度負責的、嚴肅的、認真的、務實的精神，以戰略家的眼光，將專案置於整個國際國內大市場進行縱向分析和橫向比較，堅決避免盲目建設、重複建設等現象的發生，使專案建成後確實能夠創造良好的效益，發揮應有的作用。同時要使用科學的方法，在評估工作中，注意全面調查與重點核查相結合，定量分析與定性分析相結合，經驗總結與科學預測相結合，以保證相關專案資料的客觀性、使用方法的科學性和評估結論的正確性。