1、概念不同
窩藏罪是明知是罪犯而為其提供隱蔽處所，使其逃避法律制裁的行為。
包庇罪是明知是犯罪分子，而向司法機關作虛假證明，為其掩蓋罪行，或者幫助其隱匿、毀滅罪證、湮滅罪跡，使其逃避法律制裁的行為。
2、主要特徵不同
窩藏罪的主要特徵：
(1)侵犯客體是司法機關懲治犯罪的正常活動。
(2)主觀上必須出於故意。即必須明知是犯罪分子。
(3)客觀上表現為為罪犯提供隱蔽處所或用金錢、物質資助罪犯逃往他處隱蔽的行為。
包庇罪的主要特徵是：
（1）侵犯的客體是司法機關的正常活動。
（2）在客觀方面表現為向司法機關或有關組織作虛假證明，或者幫助隱匿、毀滅罪證、湮滅罪跡，藉以幫助犯罪分子掩蓋犯罪事實，逃避法律制裁。
（3）主觀方面是故意，即明知是犯罪分子而幫助其掩蓋罪行，意圖使其逃避法律制裁。
3、行為不同
窩藏是指明知是犯罪的人而為其提供隱藏處所、財物，幫助其逃匿的行為。
包庇是指明知是犯罪的人而作假證明予以包庇的行為。
4、物件不同
窩藏的物件必頒是已經實施犯罪或越獄脫逃的罪犯。事先有通謀而事後予以窩藏的，以共犯論處。
包庇的物件必須是反革命分子和其他犯罪分子，包括犯罪之後潛逃在外、尚未抓獲歸案或尚未被司法機關發現的犯罪分子，以及已經被逮捕、拘留或被判刑勞改而越獄脫逃的犯罪分子。
擴充套件資料：
窩藏、包庇罪主觀上必須是出於故意，即明知是犯罪的人而實施窩藏、包庇行為，明知，是指認識到自己窩藏、包庇的是犯罪的人。
在開始實施窩藏、包庇行為時明知是犯罪的人，或是在開始實施窩藏、包庇行為時，不明知是犯罪的人，但發現對方是犯罪的人後仍然繼續實施窩藏、包庇行為的，構成本罪，過失不構成窩藏、包庇罪。區分窩藏、包庇的故意和過失的關鍵在於：
1、行為人是否明確知道他人犯罪，如他人已明確告知行為人自己犯了罪等等。
2、行為人是否應知道他人犯罪，如從他人的言談舉止和向行為人提出的種種要求中推斷出來。
3、窩藏、包庇行為是否違背了行為人的意志。 司法實踐中，認定行為人是否犯窩藏、包庇罪，不能光看行為人的口供，而應根據行為人的行為和案件的具體情況，結合其口供和其它相關證據，以綜合認定。
如果行為人確定不知道對方是犯罪人，或者受欺騙、矇蔽而為隱藏處所、財物、幫助其逃匿或作虛假證明包庇的，不能認定其是出於主觀的故意，也就不能認定窩藏、包庇犯罪，不能追究行為人的刑事責任。
1、概念不同
窩藏罪是明知是罪犯而為其提供隱蔽處所，使其逃避法律制裁的行為。
包庇罪是明知是犯罪分子，而向司法機關作虛假證明，為其掩蓋罪行，或者幫助其隱匿、毀滅罪證、湮滅罪跡，使其逃避法律制裁的行為。
2、主要特徵不同
窩藏罪的主要特徵：
(1)侵犯客體是司法機關懲治犯罪的正常活動。
(2)主觀上必須出於故意。即必須明知是犯罪分子。
(3)客觀上表現為為罪犯提供隱蔽處所或用金錢、物質資助罪犯逃往他處隱蔽的行為。
包庇罪的主要特徵是：
（1）侵犯的客體是司法機關的正常活動。
（2）在客觀方面表現為向司法機關或有關組織作虛假證明，或者幫助隱匿、毀滅罪證、湮滅罪跡，藉以幫助犯罪分子掩蓋犯罪事實，逃避法律制裁。
（3）主觀方面是故意，即明知是犯罪分子而幫助其掩蓋罪行，意圖使其逃避法律制裁。
3、行為不同
窩藏是指明知是犯罪的人而為其提供隱藏處所、財物，幫助其逃匿的行為。
包庇是指明知是犯罪的人而作假證明予以包庇的行為。
4、物件不同
窩藏的物件必頒是已經實施犯罪或越獄脫逃的罪犯。事先有通謀而事後予以窩藏的，以共犯論處。
包庇的物件必須是反革命分子和其他犯罪分子，包括犯罪之後潛逃在外、尚未抓獲歸案或尚未被司法機關發現的犯罪分子，以及已經被逮捕、拘留或被判刑勞改而越獄脫逃的犯罪分子。
擴充套件資料：
窩藏、包庇罪主觀上必須是出於故意，即明知是犯罪的人而實施窩藏、包庇行為，明知，是指認識到自己窩藏、包庇的是犯罪的人。
在開始實施窩藏、包庇行為時明知是犯罪的人，或是在開始實施窩藏、包庇行為時，不明知是犯罪的人，但發現對方是犯罪的人後仍然繼續實施窩藏、包庇行為的，構成本罪，過失不構成窩藏、包庇罪。區分窩藏、包庇的故意和過失的關鍵在於：
1、行為人是否明確知道他人犯罪，如他人已明確告知行為人自己犯了罪等等。
2、行為人是否應知道他人犯罪，如從他人的言談舉止和向行為人提出的種種要求中推斷出來。
3、窩藏、包庇行為是否違背了行為人的意志。 司法實踐中，認定行為人是否犯窩藏、包庇罪，不能光看行為人的口供，而應根據行為人的行為和案件的具體情況，結合其口供和其它相關證據，以綜合認定。
如果行為人確定不知道對方是犯罪人，或者受欺騙、矇蔽而為隱藏處所、財物、幫助其逃匿或作虛假證明包庇的，不能認定其是出於主觀的故意，也就不能認定窩藏、包庇犯罪，不能追究行為人的刑事責任。