（一）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，與小蘭共結連理。後來兩人有了愛情的結晶（一個男孩），取名為工藤柯南……
（二）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，但小哀在與黑暗組織的決戰中為掩護新一不幸被琴酒槍殺。新一與小蘭共結連理，後來兩人有了愛情的結晶（一個女孩），取名為工藤志保……
（三）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，但毛利小五郎在與黑暗組織的決戰中壯烈犧牲。新一繼承了毛利偵探事務所，與小蘭共結連理並改名為毛利新一，後來與小蘭有了愛情的結晶（一個女孩），取名為毛利洋子……
（四）小蘭知道了柯南的真實身份後惱羞成怒，用空手道修理柯南，結果用力過猛釀成無法挽回的悲劇……
（五）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，但在新一向小蘭告白前夕，小蘭遭遇車禍……
（六）在與黑暗組織的決戰中，小蘭不幸……，志保和新一遠走高飛……
（七）全體被黑暗組織抓住後亂槍掃射……
（八）全體被黑暗組織抓住後捆住手腳丟到海里喂鯊魚……
（九）柯南在與黑暗組織的決戰中和琴酒同歸於盡……
（十）打敗黑暗組織後，柯南沒能變回來，向小蘭表白身份後，兩人移居美國治療柯南的侏儒症……
（十一）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，但小哀因嫉妒用APTX4869給小蘭投毒，並毀掉了解藥逃走，新一隻好服下最後一顆APTX4869，又變回了柯南……
（十二）柯南終於打敗黑暗組織，但卻無法再恢復成工藤新一，向小蘭說明一切後，兩人灑淚分手……幾天之後柯南的班上轉來一個很可愛的小女孩，柯南看到她時一下子驚呆了（你知道是誰了吧）。女孩微笑著對柯南說：“我會永遠和你在一起，你再也賴不掉了！”若干年之後在夏威夷的海灘上出現了一對年輕的情侶……
（十三）知道恢復無望的柯南心灰意冷，在這時卻得到了哀的安慰。在哀的默默鼓勵下，柯南終於恢復了信心，繼續向未知挑戰，而兩人的感情也就此產生了……
（十四）柯南終於擊敗了神秘組織，但最終一戰中，頭部卻受到了重傷，並且喪失了全部記憶。由哀處得知事情真相的小蘭，卻沒理由逼迫一個小學生去思索過去的事情。於是，柯南做為一個小學生偵探，與他的夥伴們一起成長著……
（一）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，與小蘭共結連理。後來兩人有了愛情的結晶（一個男孩），取名為工藤柯南……
（二）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，但小哀在與黑暗組織的決戰中為掩護新一不幸被琴酒槍殺。新一與小蘭共結連理，後來兩人有了愛情的結晶（一個女孩），取名為工藤志保……
（三）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，但毛利小五郎在與黑暗組織的決戰中壯烈犧牲。新一繼承了毛利偵探事務所，與小蘭共結連理並改名為毛利新一，後來與小蘭有了愛情的結晶（一個女孩），取名為毛利洋子……
（四）小蘭知道了柯南的真實身份後惱羞成怒，用空手道修理柯南，結果用力過猛釀成無法挽回的悲劇……
（五）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，但在新一向小蘭告白前夕，小蘭遭遇車禍……
（六）在與黑暗組織的決戰中，小蘭不幸……，志保和新一遠走高飛……
（七）全體被黑暗組織抓住後亂槍掃射……
（八）全體被黑暗組織抓住後捆住手腳丟到海里喂鯊魚……
（九）柯南在與黑暗組織的決戰中和琴酒同歸於盡……
（十）打敗黑暗組織後，柯南沒能變回來，向小蘭表白身份後，兩人移居美國治療柯南的侏儒症……
（十一）柯南終於打敗黑暗組織並找到恢復身體的方法，但小哀因嫉妒用APTX4869給小蘭投毒，並毀掉了解藥逃走，新一隻好服下最後一顆APTX4869，又變回了柯南……
（十二）柯南終於打敗黑暗組織，但卻無法再恢復成工藤新一，向小蘭說明一切後，兩人灑淚分手……幾天之後柯南的班上轉來一個很可愛的小女孩，柯南看到她時一下子驚呆了（你知道是誰了吧）。女孩微笑著對柯南說：“我會永遠和你在一起，你再也賴不掉了！”若干年之後在夏威夷的海灘上出現了一對年輕的情侶……
（十三）知道恢復無望的柯南心灰意冷，在這時卻得到了哀的安慰。在哀的默默鼓勵下，柯南終於恢復了信心，繼續向未知挑戰，而兩人的感情也就此產生了……
（十四）柯南終於擊敗了神秘組織，但最終一戰中，頭部卻受到了重傷，並且喪失了全部記憶。由哀處得知事情真相的小蘭，卻沒理由逼迫一個小學生去思索過去的事情。於是，柯南做為一個小學生偵探，與他的夥伴們一起成長著……