1、柱溫波動。（即使是很小的溫度變化都會引起基線的波動。通常影響示差檢測器、電導檢測器、較低靈敏度的紫外檢測器或其它光電類檢測器。）

控制好柱子和流動相的溫度，在檢測器之前使用熱交換器圖

2、流動相不均勻。（流動相條件變化引起的基線漂移大於溫度導致的漂移。）

使用HPLC級的溶劑，高純度的鹽和新增劑。流動相在使用前進行脫氣，使用中使用氦氣。

3、流通池被汙染或有氣體

用甲醇或其他強極性溶劑沖洗流通池。如有需要，可以用1N的硝酸。（不要用鹽酸）

4、檢測器出口阻塞。（高壓造成流通池視窗破裂，產生噪音基線）

取出阻塞物或更換管子。參考檢測器手冊更換流通池窗。

5、流動相配比不當或流速變化

更改配比或流速。為避免這個問題可定期檢查流動相組成及流速。

6、柱平衡慢，特別是流動相發生變化時

用中等強度的溶劑進行沖洗，更改流動相時，在分析前用10-20倍體積的新流動相對柱子進行沖洗。

7、流動相汙染、變質或由低品質溶劑配成

檢查流動相的組成。使用高品質的化學試劑及HPLC級的溶劑

8、樣品中有強保留的物質（高K’值）以饅頭峰樣被洗脫出，從而表現出一個逐步升高的基線。

使用保護柱，如有必要，在進樣之間或在分析過程中，定期用強溶劑沖洗柱子。

9、使用迴圈溶劑，但檢測器未調整。

重新設定基線。當檢測器動力學範圍發生變化時，使用新的流動相。

10、檢測器沒有設定在最大吸收波長處。

將波長調整至最大吸收波長處