關於病毒的起源問題，眾說紛紜，歸納起來主要有下列三種假說：
(1) 認為病毒是原始生物物種的後裔：按照生物進化的一般規律，地球上還沒有出現細胞的時候，就已存在一些大分子的生命物質，如蛋白質和核酸等。經過許多萬年漫長時間的進化，這些原始生命物質中的某一些，逐漸在結構上覆雜起來，開始具備細胞構造而成為單細胞生物，其中更有一些進一步進化為多細胞生物，乃至高階動、植物。但是也有一些原始生命物質繼續保持非細胞形態，並且逐漸適應在其他生物細胞內營寄生方式，這就是我們目前所知的病毒。其寄生於細菌等微生物者，稱為細菌病毒，即噬菌體；其寄生於植物者，稱為植物病毒；其寄生於動物者，稱為動物病毒。某些動物病毒與植物病毒在結構組成上的相似性或同源性，例如人類鼻病毒的結構蛋白與某些植物病毒相似，說明了它們之間在起源上的聯絡，似乎有利於這一假說。但是反對這一假說的人們認為，既然病毒缺乏獨立的自身複製能力，必須依賴宿主細胞來進行增殖，那麼就很難想像病毒是起源於細胞形態存在之前，而不是在細胞形態存在之後。我們認為，這一看法難以讓人接受，因如上述，病毒的寄生性是在漫長的進化過程中逐步形成的。
(2) 認為病毒來源於細胞核酸：病毒的基因組可能就是細胞的染色體或線粒體的基因物質。由於某種原因，這些核酸脫離細胞而獨立存在，隨而經過進一步演化而具備專性寄生的特性。這就是所謂的內源性學說。這一學說將反轉錄病毒視為細胞DNA片段的RNA轉錄產。 近年發現，某些RNA腫瘤病毒中存在癌基因，但在正常機體細胞中存在與之相似的基因(稱為原癌基因)，且癌基因和原癌基因的序列高度同源。這些發現似乎有利於內源性學說的成立，因為病毒的癌基因可能就是隨某些細胞核酸脫落或逃逸出來的一個組成成分。當然，DNA腫瘤病毒中也發現有癌基因，但是為什麼迄今在細胞內一直沒有找到相應的細胞原癌基這是有待進一步探索和說明的問題了。
(3) 認為病毒是某些較高階微生物的退行性生命物質：也就是說，是這些微生物在退化過程中丟失了某些遺傳資訊，以致不能自身增殖，而必須依賴較高階細胞才能複製，並逐漸演化為現在的病毒。從辯證唯物主義和進化論的觀點來看，我們傾向於將病毒看作為原始生命形態的發展產物。
關於病毒的起源問題，眾說紛紜，歸納起來主要有下列三種假說：
(1) 認為病毒是原始生物物種的後裔：按照生物進化的一般規律，地球上還沒有出現細胞的時候，就已存在一些大分子的生命物質，如蛋白質和核酸等。經過許多萬年漫長時間的進化，這些原始生命物質中的某一些，逐漸在結構上覆雜起來，開始具備細胞構造而成為單細胞生物，其中更有一些進一步進化為多細胞生物，乃至高階動、植物。但是也有一些原始生命物質繼續保持非細胞形態，並且逐漸適應在其他生物細胞內營寄生方式，這就是我們目前所知的病毒。其寄生於細菌等微生物者，稱為細菌病毒，即噬菌體；其寄生於植物者，稱為植物病毒；其寄生於動物者，稱為動物病毒。某些動物病毒與植物病毒在結構組成上的相似性或同源性，例如人類鼻病毒的結構蛋白與某些植物病毒相似，說明了它們之間在起源上的聯絡，似乎有利於這一假說。但是反對這一假說的人們認為，既然病毒缺乏獨立的自身複製能力，必須依賴宿主細胞來進行增殖，那麼就很難想像病毒是起源於細胞形態存在之前，而不是在細胞形態存在之後。我們認為，這一看法難以讓人接受，因如上述，病毒的寄生性是在漫長的進化過程中逐步形成的。
(2) 認為病毒來源於細胞核酸：病毒的基因組可能就是細胞的染色體或線粒體的基因物質。由於某種原因，這些核酸脫離細胞而獨立存在，隨而經過進一步演化而具備專性寄生的特性。這就是所謂的內源性學說。這一學說將反轉錄病毒視為細胞DNA片段的RNA轉錄產。 近年發現，某些RNA腫瘤病毒中存在癌基因，但在正常機體細胞中存在與之相似的基因(稱為原癌基因)，且癌基因和原癌基因的序列高度同源。這些發現似乎有利於內源性學說的成立，因為病毒的癌基因可能就是隨某些細胞核酸脫落或逃逸出來的一個組成成分。當然，DNA腫瘤病毒中也發現有癌基因，但是為什麼迄今在細胞內一直沒有找到相應的細胞原癌基這是有待進一步探索和說明的問題了。
(3) 認為病毒是某些較高階微生物的退行性生命物質：也就是說，是這些微生物在退化過程中丟失了某些遺傳資訊，以致不能自身增殖，而必須依賴較高階細胞才能複製，並逐漸演化為現在的病毒。從辯證唯物主義和進化論的觀點來看，我們傾向於將病毒看作為原始生命形態的發展產物。