1.將0.8%的瓊脂糖在0.25×TBE中熔化後冷卻至50~60℃,立即注入凝膠框架中,並插入梳子。
2.凝膠固化後小心地拔出齒梳,用2把無菌手術刀將DNA凝膠塊上樣。若用不同內切酶消化凝膠塊,則取不同樣品時應將手術刀片燒灼後冷卻。將DNA大小標誌物上樣至凝膠的兩旁。
3.用1%液態低熔點瓊脂糖凝膠(0.25×TBE配製)密封狹槽。
4.若有氣泡存在,用注射器驅趕氣泡。
5.一旦密封的低熔點瓊脂糖已固化(大約10min),可將凝膠擱入腔室,並用電泳緩衝液覆蓋過膠面。
6.應設定合適的電壓及轉換時間(參考《分子醫學技術》84頁表8.1)並開始電泳。兩個不同電泳方向的電流應相等。
7.電泳結束後,凝膠用0.25×TBE配製成的EB(0.4μg/ml)染色。
8.用泵自槽中排除緩衝液,續以雙蒸水沖洗電泳槽。
9.凝膠成像:DNA在曝光的過程中可能會形成缺口。
10. 用0.25mol/L HCl漂洗凝膠30min,讓DNA脫嘌呤,並有利於轉移。
11. 凝膠用鹼(變性溶液中)變性20min,兩次,續以中性溶液1~5min。
12. 採用標準Southern印跡方案將DNA轉印至尼龍膜上。一般來說,印跡PFGE凝膠的時間較普通凝膠印跡時間長(約48h)。
https://iknow-pic.cdn.bcebos.com/2f738bd4b31c8701070fe133207f9e2f0608ffae
1.將0.8%的瓊脂糖在0.25×TBE中熔化後冷卻至50~60℃,立即注入凝膠框架中,並插入梳子。
2.凝膠固化後小心地拔出齒梳,用2把無菌手術刀將DNA凝膠塊上樣。若用不同內切酶消化凝膠塊,則取不同樣品時應將手術刀片燒灼後冷卻。將DNA大小標誌物上樣至凝膠的兩旁。
3.用1%液態低熔點瓊脂糖凝膠(0.25×TBE配製)密封狹槽。
4.若有氣泡存在,用注射器驅趕氣泡。
5.一旦密封的低熔點瓊脂糖已固化(大約10min),可將凝膠擱入腔室,並用電泳緩衝液覆蓋過膠面。
6.應設定合適的電壓及轉換時間(參考《分子醫學技術》84頁表8.1)並開始電泳。兩個不同電泳方向的電流應相等。
7.電泳結束後,凝膠用0.25×TBE配製成的EB(0.4μg/ml)染色。
8.用泵自槽中排除緩衝液,續以雙蒸水沖洗電泳槽。
9.凝膠成像:DNA在曝光的過程中可能會形成缺口。
10. 用0.25mol/L HCl漂洗凝膠30min,讓DNA脫嘌呤,並有利於轉移。
11. 凝膠用鹼(變性溶液中)變性20min,兩次,續以中性溶液1~5min。
12. 採用標準Southern印跡方案將DNA轉印至尼龍膜上。一般來說,印跡PFGE凝膠的時間較普通凝膠印跡時間長(約48h)。
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