今房山區轄境，在秦朝始設廣陽郡良鄉縣（治所在今竇店鎮西安莊村）。漢朝良鄉縣一度改梁鄉侯國，今房山區轄境又設燕國廣陽縣（治所在今長陽鎮南、北廣陽城村）、涿郡西鄉侯國（治所在今長溝鎮東長溝村北）、涿郡利鄉侯國（治所不明）。

三國至南北朝，良鄉多屬各政權所設幽州、涿郡管轄，西鄉、利鄉、廣陽陸續廢並。隋唐五代期間，良鄉縣屬幽州。遼朝屬南京道幽都府，宋朝屬燕山府，金朝屬中都路永安府。

金大定二十九年（1189年），析良鄉縣置萬寧縣（治所在今城關街道），明昌二年（1191年）更名奉先縣，屬中都路涿州。

元朝良鄉縣屬燕京路大興府，後改屬中都路大興府、大都路總管府。奉先縣於至元二十七年（1290年）改稱房山縣，屬大都路涿州。明朝良鄉縣直屬順天府，房山縣屬順天府涿州。

清朝良鄉縣、房山縣均屬順天府。民國時，良鄉縣、房山縣屬京兆地方，1928年劃歸河北省。1949年後，良鄉縣、房山縣屬河北省通縣專區。

1958年，房山縣、良鄉縣合併為周口店區，劃入北京市。1960年，改稱房山縣。1981年，析置燕山區。1987年，燕山區、房山縣合併為房山區。

擴充套件資料：

北京公共交通控股（集團）有限公司：第三客運分公司（391路、616路、646路、專93路、專94路）、第六客運分公司（房山區全境）

涿州市春雷客運有限公司（京冀跨省公交）：涿州19路、涿州19路支線、涿州22路

北京地鐵系統在房山區內建設和規劃中線路：北京地鐵燕房線（支線，在建）、北京地鐵21號線（房山區境內設兩站，規劃中）、北京地鐵四環線（遠景規劃）。