沉香是在沉香樹生長的過程中形成的。沉香樹結出沉香必須要有這樣幾個條件：樹種、受傷、真菌入侵、持續感染。
第二，受傷是結香的必要條件，在自然界中，樹體受傷為小機率事件，受傷原因主要有昆蟲蛀蝕、動物攀爬碰撞、泥石流、風吹雨打等。一旦沉香樹因外力作用而受傷，沉香樹作為生命體會立刻產生應激反應，分泌大量樹液，其中主要含有三種成分：一為營養因子，比喻為樹的“紅血球”，其作用是提供養料促進受傷組織恢復；二為抗體因子，比喻為樹的“白血球”，其作用是抵禦外來入侵，抗感染；三為凝固因子，比喻為樹的“血小板”，凝固傷口區域性，保障樹液不至於大量流失。當今科學研究證明，營養因子物質是在沉香樹正常生長過程中就存在的，只是樹體受傷後分泌的速度加快；而抗體因子有一些是原先樹體內就有的，另一些物質則是正常生長中不存在的，比如苄基丙酮等抑制真菌擴散的物質；凝固因子物質在正常樹體內含量極少，此部分物質很可能是樹的某些組織細胞破壁後所出現的，屬於樹體的自我保護機理。需要特別說明一下的是，沉香樹樹體在正常情況下不會分泌芳香物質，此時的沉香樹並沒有香味。即使在受傷後，沉香樹依然沒有沉香的香氣。
第三，真菌入侵是結香的關鍵環節。在樹體受傷恢復過程中，如果周邊環境中的溫度、溼度等條件適合，而正好傷口周邊存在適合的真菌，菌群就會透過沉香樹傷口表皮入侵樹體，並且迅速以樹液中的營養因子為培養基進行復雜的生物反應過程，真菌在厭氧環境下產生了很多了很多代謝物，而這些代謝物中含有大量沉香樹原本所沒有的新的芳香物質，而這些芳香物質就是沉香香氣的來源此時，沉香樹內凝固因子會大量生成，並逐漸凝固被感染區域內的部分脈管中的樹液，以此來抵抗真菌的進一步入侵。這時，雖然沉香樹種已經有芳香物質，但其量極少，並不成形，還不能成為沉香。
第四，感染的持續和擴散。真菌感染和代謝不僅停留在傷口位置，還會沿著樹體的營養管道進一步入侵，這就是我們通常所說的感染擴散過程。在各種條件滿足下，在沉香樹內，真菌不斷擴大感染，不斷與樹體內的各種因子相互作用，持續產生芳香物質，又不斷被樹的凝固因子凝結在脈管中，這個感染、反應、產生芳香物質、被凝固、再擴散感染的過程，週而復始。迴圈往復，被稱為持續感染階段。這一階段是持續結香並最終結出成塊沉香的保證。
最終，在沉香樹體內，新生成的髮香物質、真菌本體、真菌其他不髮香代謝物、真菌死亡殘留物、沉香樹組織殘留物以及樹液中的部分物質在沉香樹的凝固因子作用下，與樹的木質纖維凝結固化在了一起。這時，沉香樹種就出現了一種由凝固的有機化合物才是沉香，而這個“樹體受傷、真菌感染、感染擴散、樹體抗感染、真菌代謝、產生芳香物質、被凝固、與木纖維一起形成混合物”的過程就是沉香的結香過程。
現在我們解讀沉香的結香過程看似很清楚，而實際上在樹體內，這一過程全部是在人肉眼無法識別的細胞層面上進行的。在樹體內這個結香的過程是在數不清的樹體細胞和真菌之間同時進行的，而最終能形成被我們肉眼所辨認的成品沉香需要漫長的時間和苛刻的條件。真菌生物反應的速度緩慢，新的芳香物質的生成也緩慢，凝固過程更是緩慢的。只有在合適的溫度、溼度等外部條件以及樹體本身內部條件雙重滿足下，感染才會持續擴散，沉香樹才能持續結香。而在自然界中，一旦條件變化，結香過程就可能終止，也就難以結出成形的沉香。從這個角度來看，能孕育體積碩大的野生沉香，確實是一件非常困難的事情。
結香過程中至關重要的是真菌入侵和感染過程。實際上真菌代謝的全過程至今並沒有被完全破解。目前，生物研究在該領域只判定真菌感染可以分解沉香樹的營養因子和部分抗體因子，並導致新的色酮類芳香物質的出現。但是，是否芳香物質都是真菌的代謝產物，有沒有某些芳香物質是來自沉香樹樹體本身細胞的應激自我保護反應還不得而知。目前可以肯定的幾點是：
1.沉香樹之所以可以無中生有地產生芳香物質是由真菌感染誘發，目前已知的可以誘發感染真菌的黃綠墨耳真菌，這一菌種的感染作用也在人工種植沉香中得以驗證。至於是否又其他菌種參與結香，尚不明確。
2.樹體在受傷時會產生新的抗體因子比如新的化學成分苄基丙酮。新的抗體和老抗體都參與抑制真菌生長，而抗體因子對最終結香是不可或缺的。
3.真菌的代謝肯定可以導致新的芳香物質的生成，特別是苄基丙酮在真菌作用下可產生新的色酮類芳香物質。
4.結香是在樹體內輸送養料的通道（樹的脈絡）中完成，會因樹種的不同呈現不同的凝固表現，同時會伴有對樹體木纖維的侵潤。
5.感染的擴大是從原病灶區向其他組織蔓延、擴散的總趨勢，是順著樹的脈絡而進行。因樹體內的結構問題，與樹體生長同方向上的擴散更快，相垂直的方向較慢。也就是說，如果是主幹受傷，則受傷部位上下結香快而且大，左右結香較慢、較小，內外結香最慢、最小。
6.固化後的沉香包含完整的樹木質纖維，且凝固不會改變木纖維的原有形態。
沉香的結香是一個複雜而神秘的過程。目前我們對此的認知也僅停留在上述而已，其中還存在更多的未知。比如我們已知可以誘發沉香樹結香的真菌有“黃綠墨耳真菌”，但除此之外，可以誘發沉香樹結香的真菌還有哪些？在已知的野生沉香中發現的二十多種原生伴隨真菌是否有些也可以導致或參與了結香過程？特殊的沉香品種，會不會是由特殊真菌所誘發結香的？是否所有沉香中的所有芳香物質都是由真菌代謝所產生的？是否有部分芳香物質是由自身免疫系統所分泌的？野生沉香到底需要怎樣的溫度、溼度等外界條件？
至此，我們對於沉香樹以及沉香的結香原理和過程已經有了大致瞭解。我們可以得出沉香的一般概念。沉香，一種天然香料，多產於南亞及中國南部，生成於雙子葉植物綱錦葵目瑞香科沉香屬多年生喬木類植物（通用名沉香樹）上，是因樹體受傷且被真菌感染，並由此誘發結香現象出現，最終聚結凝固而成的，表現為有機化合物與木纖維互混互粘的一種混合物，其化學析出物主要為倍半萜類及色酮類有機物並要求達到一定的含量，在一定的溫度下可散發香氣，可入藥，有寧神、理氣、通竅、溫中、固精等療效。
沉香是在沉香樹生長的過程中形成的。沉香樹結出沉香必須要有這樣幾個條件：樹種、受傷、真菌入侵、持續感染。
第二，受傷是結香的必要條件，在自然界中，樹體受傷為小機率事件，受傷原因主要有昆蟲蛀蝕、動物攀爬碰撞、泥石流、風吹雨打等。一旦沉香樹因外力作用而受傷，沉香樹作為生命體會立刻產生應激反應，分泌大量樹液，其中主要含有三種成分：一為營養因子，比喻為樹的“紅血球”，其作用是提供養料促進受傷組織恢復；二為抗體因子，比喻為樹的“白血球”，其作用是抵禦外來入侵，抗感染；三為凝固因子，比喻為樹的“血小板”，凝固傷口區域性，保障樹液不至於大量流失。當今科學研究證明，營養因子物質是在沉香樹正常生長過程中就存在的，只是樹體受傷後分泌的速度加快；而抗體因子有一些是原先樹體內就有的，另一些物質則是正常生長中不存在的，比如苄基丙酮等抑制真菌擴散的物質；凝固因子物質在正常樹體內含量極少，此部分物質很可能是樹的某些組織細胞破壁後所出現的，屬於樹體的自我保護機理。需要特別說明一下的是，沉香樹樹體在正常情況下不會分泌芳香物質，此時的沉香樹並沒有香味。即使在受傷後，沉香樹依然沒有沉香的香氣。
第三，真菌入侵是結香的關鍵環節。在樹體受傷恢復過程中，如果周邊環境中的溫度、溼度等條件適合，而正好傷口周邊存在適合的真菌，菌群就會透過沉香樹傷口表皮入侵樹體，並且迅速以樹液中的營養因子為培養基進行復雜的生物反應過程，真菌在厭氧環境下產生了很多了很多代謝物，而這些代謝物中含有大量沉香樹原本所沒有的新的芳香物質，而這些芳香物質就是沉香香氣的來源此時，沉香樹內凝固因子會大量生成，並逐漸凝固被感染區域內的部分脈管中的樹液，以此來抵抗真菌的進一步入侵。這時，雖然沉香樹種已經有芳香物質，但其量極少，並不成形，還不能成為沉香。
第四，感染的持續和擴散。真菌感染和代謝不僅停留在傷口位置，還會沿著樹體的營養管道進一步入侵，這就是我們通常所說的感染擴散過程。在各種條件滿足下，在沉香樹內，真菌不斷擴大感染，不斷與樹體內的各種因子相互作用，持續產生芳香物質，又不斷被樹的凝固因子凝結在脈管中，這個感染、反應、產生芳香物質、被凝固、再擴散感染的過程，週而復始。迴圈往復，被稱為持續感染階段。這一階段是持續結香並最終結出成塊沉香的保證。
最終，在沉香樹體內，新生成的髮香物質、真菌本體、真菌其他不髮香代謝物、真菌死亡殘留物、沉香樹組織殘留物以及樹液中的部分物質在沉香樹的凝固因子作用下，與樹的木質纖維凝結固化在了一起。這時，沉香樹種就出現了一種由凝固的有機化合物才是沉香，而這個“樹體受傷、真菌感染、感染擴散、樹體抗感染、真菌代謝、產生芳香物質、被凝固、與木纖維一起形成混合物”的過程就是沉香的結香過程。
現在我們解讀沉香的結香過程看似很清楚，而實際上在樹體內，這一過程全部是在人肉眼無法識別的細胞層面上進行的。在樹體內這個結香的過程是在數不清的樹體細胞和真菌之間同時進行的，而最終能形成被我們肉眼所辨認的成品沉香需要漫長的時間和苛刻的條件。真菌生物反應的速度緩慢，新的芳香物質的生成也緩慢，凝固過程更是緩慢的。只有在合適的溫度、溼度等外部條件以及樹體本身內部條件雙重滿足下，感染才會持續擴散，沉香樹才能持續結香。而在自然界中，一旦條件變化，結香過程就可能終止，也就難以結出成形的沉香。從這個角度來看，能孕育體積碩大的野生沉香，確實是一件非常困難的事情。
結香過程中至關重要的是真菌入侵和感染過程。實際上真菌代謝的全過程至今並沒有被完全破解。目前，生物研究在該領域只判定真菌感染可以分解沉香樹的營養因子和部分抗體因子，並導致新的色酮類芳香物質的出現。但是，是否芳香物質都是真菌的代謝產物，有沒有某些芳香物質是來自沉香樹樹體本身細胞的應激自我保護反應還不得而知。目前可以肯定的幾點是：
1.沉香樹之所以可以無中生有地產生芳香物質是由真菌感染誘發，目前已知的可以誘發感染真菌的黃綠墨耳真菌，這一菌種的感染作用也在人工種植沉香中得以驗證。至於是否又其他菌種參與結香，尚不明確。
2.樹體在受傷時會產生新的抗體因子比如新的化學成分苄基丙酮。新的抗體和老抗體都參與抑制真菌生長，而抗體因子對最終結香是不可或缺的。
3.真菌的代謝肯定可以導致新的芳香物質的生成，特別是苄基丙酮在真菌作用下可產生新的色酮類芳香物質。
4.結香是在樹體內輸送養料的通道（樹的脈絡）中完成，會因樹種的不同呈現不同的凝固表現，同時會伴有對樹體木纖維的侵潤。
5.感染的擴大是從原病灶區向其他組織蔓延、擴散的總趨勢，是順著樹的脈絡而進行。因樹體內的結構問題，與樹體生長同方向上的擴散更快，相垂直的方向較慢。也就是說，如果是主幹受傷，則受傷部位上下結香快而且大，左右結香較慢、較小，內外結香最慢、最小。
6.固化後的沉香包含完整的樹木質纖維，且凝固不會改變木纖維的原有形態。
沉香的結香是一個複雜而神秘的過程。目前我們對此的認知也僅停留在上述而已，其中還存在更多的未知。比如我們已知可以誘發沉香樹結香的真菌有“黃綠墨耳真菌”，但除此之外，可以誘發沉香樹結香的真菌還有哪些？在已知的野生沉香中發現的二十多種原生伴隨真菌是否有些也可以導致或參與了結香過程？特殊的沉香品種，會不會是由特殊真菌所誘發結香的？是否所有沉香中的所有芳香物質都是由真菌代謝所產生的？是否有部分芳香物質是由自身免疫系統所分泌的？野生沉香到底需要怎樣的溫度、溼度等外界條件？
至此，我們對於沉香樹以及沉香的結香原理和過程已經有了大致瞭解。我們可以得出沉香的一般概念。沉香，一種天然香料，多產於南亞及中國南部，生成於雙子葉植物綱錦葵目瑞香科沉香屬多年生喬木類植物（通用名沉香樹）上，是因樹體受傷且被真菌感染，並由此誘發結香現象出現，最終聚結凝固而成的，表現為有機化合物與木纖維互混互粘的一種混合物，其化學析出物主要為倍半萜類及色酮類有機物並要求達到一定的含量，在一定的溫度下可散發香氣，可入藥，有寧神、理氣、通竅、溫中、固精等療效。