《仙劍奇俠傳三》故事發生在《仙劍》第一代的五十年前，那時候，李三思剛剛發出赤子的第一聲啼哭；巫後還是襁褓中的嬰兒，而劍聖，則還沒有拜入蜀山修仙……
事情的起因是從鎖妖塔頂端突然坍塌，封印被解除開始的，但是，更深層的因果卻要追溯到千年前的神界。
神將軍飛蓬與魔將軍重樓因兩界的衝突而屢屢交手，一直難分勝負，兩人逐漸有惺惺相惜之意。
重樓提出要和飛蓬在自己發現的一處新仙界中決鬥，一較高下，飛蓬礙於神界天規而猶豫再三，最終經不起重樓誘惑而答允。
兩人勢均力敵，比試曠日持久，最終驚動了天庭，天帝派兵捉拿飛蓬問罪，飛蓬因感知到追兵將至而分心，佩劍被重樓打落人間而落敗……
光陰荏苒，飛蓬被神界問罪貶為人，經過多次轉世成為渝州唐門永安當鋪夥計景天。
同時，重樓自魔界窺探人間，偶然發現飛蓬的轉世如此卑微平凡，心中動念想要幫助景天，於是來到人間，滋擾蜀山，想要幫飛蓬找回佩劍，無意中毀壞了鎖妖塔，偶然得到了飛蓬在人間第一世——姜國太子龍陽——鑄煉的魔劍。
景天得到魔劍的同時，結識了唐門小姐雪見，從此改變了自己的生活。
一開始被捲入雪見家族的內部鬥爭以及唐門和霹靂堂的爭鬥之中，而後遇到蜀山棄徒長卿及其未婚妻紫萱，景天走上了協助蜀山尋找五靈珠，封印鎖妖塔的漫漫征途。
一直隱藏在魔劍中的鬼魂化身而出，竟然是景天前世龍陽的妹妹龍葵。
幾個人的情愛糾葛，生離死別反覆交織糾纏，雪見的離奇身世，紫萱不為人知的秘密，龍葵長久以來的心中願望……伴隨著人類與妖界死生存亡的爭鬥，而其實人的慾望，才是所有紛爭的本源。
大宇指出《仙劍奇俠傳3》使用的3D遊戲引擎，歷時兩年開發完成，著重強化色彩和形體的處理，加入瞭如LightMap、柔性面板系統、實時粒子系統等等，符合《仙劍》所要表現的唯美柔情風格。
在美術風格上重現並傳遞給玩家跟第一代一樣的感覺。場景部分注重水、霧、雲海的表現，結合強大的粒子功能，產生仙境般如夢如幻的感覺。
人物設定上仙三的人身比例採與仙劍1相同卡通版，顏色上則揉合了仙劍1的中國工筆重彩和日式卡通風格，並加重“明亮”感，而創造出全新的仙三人物。
《仙劍奇俠傳三》故事發生在《仙劍》第一代的五十年前，那時候，李三思剛剛發出赤子的第一聲啼哭；巫後還是襁褓中的嬰兒，而劍聖，則還沒有拜入蜀山修仙……
事情的起因是從鎖妖塔頂端突然坍塌，封印被解除開始的，但是，更深層的因果卻要追溯到千年前的神界。
神將軍飛蓬與魔將軍重樓因兩界的衝突而屢屢交手，一直難分勝負，兩人逐漸有惺惺相惜之意。
重樓提出要和飛蓬在自己發現的一處新仙界中決鬥，一較高下，飛蓬礙於神界天規而猶豫再三，最終經不起重樓誘惑而答允。
兩人勢均力敵，比試曠日持久，最終驚動了天庭，天帝派兵捉拿飛蓬問罪，飛蓬因感知到追兵將至而分心，佩劍被重樓打落人間而落敗……
光陰荏苒，飛蓬被神界問罪貶為人，經過多次轉世成為渝州唐門永安當鋪夥計景天。
同時，重樓自魔界窺探人間，偶然發現飛蓬的轉世如此卑微平凡，心中動念想要幫助景天，於是來到人間，滋擾蜀山，想要幫飛蓬找回佩劍，無意中毀壞了鎖妖塔，偶然得到了飛蓬在人間第一世——姜國太子龍陽——鑄煉的魔劍。
景天得到魔劍的同時，結識了唐門小姐雪見，從此改變了自己的生活。
一開始被捲入雪見家族的內部鬥爭以及唐門和霹靂堂的爭鬥之中，而後遇到蜀山棄徒長卿及其未婚妻紫萱，景天走上了協助蜀山尋找五靈珠，封印鎖妖塔的漫漫征途。
一直隱藏在魔劍中的鬼魂化身而出，竟然是景天前世龍陽的妹妹龍葵。
幾個人的情愛糾葛，生離死別反覆交織糾纏，雪見的離奇身世，紫萱不為人知的秘密，龍葵長久以來的心中願望……伴隨著人類與妖界死生存亡的爭鬥，而其實人的慾望，才是所有紛爭的本源。
大宇指出《仙劍奇俠傳3》使用的3D遊戲引擎，歷時兩年開發完成，著重強化色彩和形體的處理，加入瞭如LightMap、柔性面板系統、實時粒子系統等等，符合《仙劍》所要表現的唯美柔情風格。
在美術風格上重現並傳遞給玩家跟第一代一樣的感覺。場景部分注重水、霧、雲海的表現，結合強大的粒子功能，產生仙境般如夢如幻的感覺。
人物設定上仙三的人身比例採與仙劍1相同卡通版，顏色上則揉合了仙劍1的中國工筆重彩和日式卡通風格，並加重“明亮”感，而創造出全新的仙三人物。