啟動子：與RNA聚合酶結合並能起始mRNA合成的序列。

轉錄起始點：轉錄時，RNA鏈第一個核苷酸相對應DNA鏈上的鹼基，通常為一個嘌呤。

一般啟動子位於轉錄起始點上游，具體位置關係如下：

真核生物有3類RNA聚合酶，負責轉錄3類不同的啟動子。

RNA聚合酶I負責轉錄的rRNA基因，啟動子（I類）較單一，由轉錄起始位點附近的兩部分序列構成。第一部分是核心啟動子，由-45—+20位核苷酸組成，單獨存在時就足以起始轉錄。另一部分由-170—-107位序列組成，稱為上游調控元件，能有效地增強轉錄效率。

RNA聚合酶Ⅲ負責轉錄的是5SrRNA、tRNA和某些核內小分子RNA（snRNA），其啟動子（Ⅲ類）組成較複雜，又可被分為三個亞類。兩類5S

rRNA和tRNA基因的啟動子是內部啟動子，位於轉錄起始位點的下游，都由兩部分組成。第三類啟動子由三個部分組成，位於轉錄起始位點上游。

RNA聚合酶II負責轉錄的II類基因包括所有蛋白質編碼基因和部分snRNA基因，後者的啟動子結構與III類基因啟動子中的第三種類型相似。編碼蛋白質的II類基因啟動子在結構上有共同的保守序列，多數II類啟動子有一個被稱為TATA盒的共有序列，通常處於-30區，相對於轉錄起始位點的位置比較固定，也有一些II類啟動子不含有TATA盒，這樣的啟動子稱為無TATA盒啟動子。

原核生物啟動子是由兩段彼此分開且又高度保守的核苷酸序列-35區和-10區組成，位置關係：-35區，-10區與-35區之間的間隔，-10區，間隔，轉錄起始位點