這主要與生長素的作用有關。頂芽產生的生長素向下，輸送，使側芽部位的生長素濃度過高，因而抑制著側芽的生長。生長素濃度低時有促進生長作用,高時反之

生長素

或稱生長素抑制學說。K.V.蒂曼和F.斯科格於1933年提出。他們的實驗證明，在蠶豆切除頂端後的斷面上施加生長素，側芽萌發受抑制，與不切除頂端的相同。他們認為頂芽是生長素合成的中心，在這裡合成的生長素沿莖向基部運輸，抑制側芽生長。這是生長素直接抑制學說。R.斯諾於1937年提出，生長素並不直接抑制側芽生長,而是引起一種間接的抑制作用,這是生長素間接抑制學說。

頂端優勢

這一學說也是最盛行的，其實驗依據是：除去頂端，側芽很快生長，如去頂後在切口處塗上含有生長素的羊毛脂，側芽不能生長，即外施生長素能代替頂芽對側芽的抑制作用。

但後來有人在羽扇豆等植物上發現，在受頂端抑制的側芽中，生長素的含量比側芽生長所需的最適濃度要低得多。更發現，外施細胞分裂素給受抑制的側芽，側芽就能生長（即頂端優勢解除），故認為側芽被抑制的原因，是由於它們沒有足夠的細胞分裂素。細胞分裂素是在根中合成的，而頂芽產生的生長素的作用，可能控制細胞分裂素的運輸，由於頂芽的生長素濃度高，成為輸入物質的庫，比側芽優先得到細胞分裂素。側芽因生長素濃度低，得不到足夠的細胞分裂素，因此生長受到抑制。