物理堵塞：水源水質不佳，同時過濾系統又不夠優秀的話，水源中的泥沙之類的雜物就容易透過過濾系統進入支幹管道進而進入滴灌管，最終會卡在內鑲式貼片滴灌帶中的鋸齒狀流道中，引發滴灌管堵塞。
解決辦法：
在水泵取水口安裝分級過濾，10-60不等，攔去懸浮泥砂和雜物。或抽取水先到蓄水池中，經自然沉澱後再進一步使用，注意要進行避光處理，防止其他雜物進入，同時也可抑制藻類繁殖。根據沉澱後的水質狀況，可選擇安裝砂石過濾器、篩網式過濾器、疊片式過濾器等，作過濾處理，經過前期過濾處理水質就已經能大大提高。對於水源為井水的情況：透過洗井減少井水中泥沙雜質含量，再根據水質情況給系統配置離心加網式過濾系統或離心加疊片過濾系統。
化學堵塞：滴灌管內壁會生成較多的碳酸鹽而堵塞滴頭。碳酸鈣會因溫度和PH值的變化而發生沉澱。一般情況下，PH值大於7.5時就會發生嚴重的沉澱，從而堵塞滴灌帶、滴灌管、滴頭、滴箭的滴孔或流道。在使用水肥一體化系統施肥時，施用的肥料有時也會造成滴灌帶的堵塞。一方面劣質的水溶性肥料中大量的不溶物質會造成滴灌帶的堵塞。另一方面肥料成分與水中物質反應造成沉澱，堵塞滴灌帶。
解決辦法：選擇合適的水溶性肥料，並同樣測定肥料的酸鹼性，杜絕沉澱的發生。儘量選用優質可溶性肥料，且施肥器必須安裝在過濾器上游，減少肥料中不溶物質造成堵塞的風險，施肥結束後要用清水對系統進行沖洗，防止管道中剩餘的肥料沉澱。
生物堵塞：採用了地下滴灌管，植物根系的趨水性加上滲透不均衡，引起植物根系向滴灌管出水口生長，進而伸入出水孔造成堵塞。除此之外如果水質富含藻類生物，肥料池開始向下的滴灌系統避光措施不到位，加上肥料的營養化，容易造成微生物大量繁殖，最終可將滴灌管內壁覆蓋堵塞。
解決辦法：地上滴灌管安裝時，滴灌管上的出水孔朝上，可使水中的少量雜質沉澱在管子的底部，也可防止根系侵入滴灌孔。地下滴灌管可透過注入適當濃度的氯氣來，來殺死靠近出水孔的根系，但要控制好濃度。針對藻類生物課使用氯酸、硝酸、硫酸等酸液清晰，使用時PH值控制在5.5-6.0，同樣酸液濃度也要嚴格把控好。結束後也要再用清水沖洗。
物理堵塞：水源水質不佳，同時過濾系統又不夠優秀的話，水源中的泥沙之類的雜物就容易透過過濾系統進入支幹管道進而進入滴灌管，最終會卡在內鑲式貼片滴灌帶中的鋸齒狀流道中，引發滴灌管堵塞。
解決辦法：
在水泵取水口安裝分級過濾，10-60不等，攔去懸浮泥砂和雜物。或抽取水先到蓄水池中，經自然沉澱後再進一步使用，注意要進行避光處理，防止其他雜物進入，同時也可抑制藻類繁殖。根據沉澱後的水質狀況，可選擇安裝砂石過濾器、篩網式過濾器、疊片式過濾器等，作過濾處理，經過前期過濾處理水質就已經能大大提高。對於水源為井水的情況：透過洗井減少井水中泥沙雜質含量，再根據水質情況給系統配置離心加網式過濾系統或離心加疊片過濾系統。
化學堵塞：滴灌管內壁會生成較多的碳酸鹽而堵塞滴頭。碳酸鈣會因溫度和PH值的變化而發生沉澱。一般情況下，PH值大於7.5時就會發生嚴重的沉澱，從而堵塞滴灌帶、滴灌管、滴頭、滴箭的滴孔或流道。在使用水肥一體化系統施肥時，施用的肥料有時也會造成滴灌帶的堵塞。一方面劣質的水溶性肥料中大量的不溶物質會造成滴灌帶的堵塞。另一方面肥料成分與水中物質反應造成沉澱，堵塞滴灌帶。
解決辦法：選擇合適的水溶性肥料，並同樣測定肥料的酸鹼性，杜絕沉澱的發生。儘量選用優質可溶性肥料，且施肥器必須安裝在過濾器上游，減少肥料中不溶物質造成堵塞的風險，施肥結束後要用清水對系統進行沖洗，防止管道中剩餘的肥料沉澱。
生物堵塞：採用了地下滴灌管，植物根系的趨水性加上滲透不均衡，引起植物根系向滴灌管出水口生長，進而伸入出水孔造成堵塞。除此之外如果水質富含藻類生物，肥料池開始向下的滴灌系統避光措施不到位，加上肥料的營養化，容易造成微生物大量繁殖，最終可將滴灌管內壁覆蓋堵塞。
解決辦法：地上滴灌管安裝時，滴灌管上的出水孔朝上，可使水中的少量雜質沉澱在管子的底部，也可防止根系侵入滴灌孔。地下滴灌管可透過注入適當濃度的氯氣來，來殺死靠近出水孔的根系，但要控制好濃度。針對藻類生物課使用氯酸、硝酸、硫酸等酸液清晰，使用時PH值控制在5.5-6.0，同樣酸液濃度也要嚴格把控好。結束後也要再用清水沖洗。