在種蛋的孵化生產過程中，常出現胚胎的異常死亡。胚胎的死亡除與不合理的孵化方案有關外，種蛋的儲存期太長、儲存期內溫度過高或過低、種鴨的營養不良和疾病都會造成鴨胚胎的死亡率增高。對於孵化方案不合理這一原因，造成孵化中胚胎死亡的主要原因可能有以下幾種：（1）胚胎在孵化前期的死亡 孵化前7天胚胎的死亡率通常可佔入孵蛋的1%～3%，若超過這個範圍，表明孵化引數的設定存在問題。從胚胎髮育的角度講，造成胚胎的早期死亡率偏高的主要原因有種蛋燻蒸消毒不當（消毒液濃度過高，燻蒸時間過長）和孵化前期溫度設定過高。夏季孵化時，種蛋從溫度較低的蛋庫中取出，未經逐漸升溫處理而直接孵化，蛋殼表面出現冷凝水現象，此時若進行燻蒸消毒，往往會導致胚胎的早期死亡。（2）胚胎在孵化中期的死亡 若8～14胚齡的胚胎死亡數佔入孵蛋的5%左右，一般可視為正常情況。造成鴨胚胎在孵化中期大量死亡一般與孵化溫度過高、通風不良、翻蛋不正常有關，其中翻蛋不正常是胚胎中期死亡的最主要原因。孵化中期時，羊膜道與羊膜腔連通，蛋白開始流進羊膜腔直接被胚胎吞食，胚胎開始了出殼前的腸管營養時期，如果此時溫度、溼度及翻蛋不正常，將影響羊膜道與羊膜腔的連通，蛋白進不到羊膜腔被胚胎利用或蛋白代謝受阻，胚胎與蛋殼發生粘連，直接導致胚胎的大批死亡。（3）胚胎在孵化後期的死亡 孵化正常時，胚胎後期死亡率一般不會超過入孵蛋的5%。種蛋孵化至20～24天時，此時胚胎代謝最為旺盛，尿囊萎縮，胚胎由尿囊呼吸轉變為肺呼吸，需要大量氧氣，如果通風不良，氣體代謝發生障礙，如肺部或氣管中尚有蛋白堵塞，或胎位不正，喙部不能進入氣室利用氣室中的氧氣，胚胎即會死亡。此時如果溫度過高，胚胎呼吸加快，而氧氣量不夠，也會造成胚胎死亡。（4）出雛期間的死亡 出雛期間的胚胎死亡率在整個孵化過程中一般不超過入孵蛋的6%～7%。如超過這一數值，通常有兩種情況：一是雛鴨悶死殼內，因出雛時的高溫、高溼、通風不良所致；二是雛鴨啄殼後死亡，多因高溫、高溼致使洞口黏液較多、較稠，雛鴨啄殼時喙被粘到殼上而不能脫落，或是因落盤時溫度驟降，蛋黃未吸收完全，尿囊合攏不全所致。
在種蛋的孵化生產過程中，常出現胚胎的異常死亡。胚胎的死亡除與不合理的孵化方案有關外，種蛋的儲存期太長、儲存期內溫度過高或過低、種鴨的營養不良和疾病都會造成鴨胚胎的死亡率增高。對於孵化方案不合理這一原因，造成孵化中胚胎死亡的主要原因可能有以下幾種：（1）胚胎在孵化前期的死亡 孵化前7天胚胎的死亡率通常可佔入孵蛋的1%～3%，若超過這個範圍，表明孵化引數的設定存在問題。從胚胎髮育的角度講，造成胚胎的早期死亡率偏高的主要原因有種蛋燻蒸消毒不當（消毒液濃度過高，燻蒸時間過長）和孵化前期溫度設定過高。夏季孵化時，種蛋從溫度較低的蛋庫中取出，未經逐漸升溫處理而直接孵化，蛋殼表面出現冷凝水現象，此時若進行燻蒸消毒，往往會導致胚胎的早期死亡。（2）胚胎在孵化中期的死亡 若8～14胚齡的胚胎死亡數佔入孵蛋的5%左右，一般可視為正常情況。造成鴨胚胎在孵化中期大量死亡一般與孵化溫度過高、通風不良、翻蛋不正常有關，其中翻蛋不正常是胚胎中期死亡的最主要原因。孵化中期時，羊膜道與羊膜腔連通，蛋白開始流進羊膜腔直接被胚胎吞食，胚胎開始了出殼前的腸管營養時期，如果此時溫度、溼度及翻蛋不正常，將影響羊膜道與羊膜腔的連通，蛋白進不到羊膜腔被胚胎利用或蛋白代謝受阻，胚胎與蛋殼發生粘連，直接導致胚胎的大批死亡。（3）胚胎在孵化後期的死亡 孵化正常時，胚胎後期死亡率一般不會超過入孵蛋的5%。種蛋孵化至20～24天時，此時胚胎代謝最為旺盛，尿囊萎縮，胚胎由尿囊呼吸轉變為肺呼吸，需要大量氧氣，如果通風不良，氣體代謝發生障礙，如肺部或氣管中尚有蛋白堵塞，或胎位不正，喙部不能進入氣室利用氣室中的氧氣，胚胎即會死亡。此時如果溫度過高，胚胎呼吸加快，而氧氣量不夠，也會造成胚胎死亡。（4）出雛期間的死亡 出雛期間的胚胎死亡率在整個孵化過程中一般不超過入孵蛋的6%～7%。如超過這一數值，通常有兩種情況：一是雛鴨悶死殼內，因出雛時的高溫、高溼、通風不良所致；二是雛鴨啄殼後死亡，多因高溫、高溼致使洞口黏液較多、較稠，雛鴨啄殼時喙被粘到殼上而不能脫落，或是因落盤時溫度驟降，蛋黃未吸收完全，尿囊合攏不全所致。