這個問題的本身，其實就是錯誤的，這是因為柏林在冷戰時期，是同時歸屬於東德和西德，東德部分作為東德的首都。

所以問題應該這麼去說，為什麼合併後，把首都定為柏林，而不是西德原本的首都波昂。我們知道兩德合併，以西德為主導，為什麼西德放著好好的波昂首都不用，遷都到柏林。

這裡面主要有兩個原因。一個就是遷都柏林，有助於東西德的融合，有助於一個德國的發展。

另外一個其實就很關鍵了，這就是因為柏林在德國曆史上扮演著比較重要的作用，是德中國人內心的最為合適作為首都的城市，之前西德因為遠離西柏林，不方便讓其作為首都，現在統一了，自然將其歸位。

這就是德國統一後，為啥首都會在柏林的原因。

德國在歷史上一向都是一個分裂的國家，首先1474年奧地利皇帝把帝國改名為德意志民族神聖羅馬帝國名義上獲得統一。被拿破崙分裂後，在1871年，德國由普魯士的威廉一世統一成為除奧地利外的德意志帝國，1938年德國加入了老成員--奧地利，德意志王國所有國家獲得統一。然而在1945年第二次世界大戰後，德國再次分裂，分成東德和西德還有奧地利三個國家，東德和西德在1990年，在西德的赫爾穆特·科爾總理領導之下重新統一。

歷史上，柏林連續成為普魯士王國（1701年－1870年）、德意志帝國（1871年－1918年）、魏瑪共和國（1919年－1933年）、納粹德國（1933年－1945年）的首都。20世紀20年代，柏林是世界第三大自治市。第二次世界大戰後，柏林被分割：東柏林成為了東德的首都，西柏林成為西德在東德的一塊飛地，被柏林牆圍住。1990年，兩德統一，柏林重新獲得全德國首都的地位，駐有147個外國大使館。 柏林無論是從文化、政治、傳媒還是科學上講都稱的上是世界級城市，扮演了一個歐洲大陸上航空與鐵路交通樞紐的角色，同時它也是全球焦點城市之一，以崇尚自由生活方式和現代精神的年輕人和藝術家而聞名。

二戰後，柏林也是被分割的，東西德分別佔領。在我印象中，柏林一直都是西德名義上的首都，波昂只是臨時首都，就跟現在以色列一樣，名義上的首都是耶路撒冷，行使首都功能的是特拉維夫一樣的。

所以德國統一之後，首都功能遷回柏林，也就順理成章。

隨著冷戰結束，東德和西德結束了近40年的對峙局面，實現了兩德統一，所以，遷都對於德國而言是特別有歷史意義的一件事，但是由於當時的柏林不具備承擔政府職能等原因，德國政府依然把政府駐地留在原西德波昂，後來隨著時機不斷成熟，德國聯邦政府才把政府遷往位於原東德的柏林，自此遷都完成。

德國的首都在柏林，德國統一後，首先拆除的就是，東，西德並列存在的標誌物柏林牆，柏林牆的拆除向世界宣告兩德統一，德國戰敗後，柏林被一分為二，東德的居民羨慕西德人生活，於是出現了向西德出逃的東德人，為了阻止這種問題。東德在柏林的統治區內修了柏林牆。就是這個牆，它真實具體說明什麼叫統一分裂。兩德統一後，1991年，經過議會投票通過，2000前將首都從波昂遷回柏林。

德國1871年才統一中歐北邊的德意志各邦建國，這個偉大程序是由普魯士王國完成的，普魯士的首都是柏林，自然統一的德國首都就也是柏林了。

二戰後德國雖然分為兩半，柏林在東德，但是柏林也是分為了兩半，當然最初是四瓣，由蘇聯和英美法四國分佔，後來英美法三個佔領國把它們的區域合併了，組成了西柏林，一直到冷戰結束德國統一。

所以說無論從歷史文化延續性還是經濟發展上面看，柏林都應該理所當然的是一個德國的首都。