只要是正常的銷售部分退回或者銷售折讓業務，都是可以開紅字發票的，沒有時間限制。

根據國家稅務總局《關於調整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關問題的通知》(國稅函〔2009〕617號)第一條規定：

增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以後開具的增值稅專用發票、公路內河貨物運輸業統一發票和機動車銷售統一發票，應在開具之日起360日內到稅務機關辦理認證(2017年7月1日及以後調整為360天)，並在認證透過的次月申報期內，向主管稅務機關申報抵扣進項稅額。

根據國家稅務總局《關於紅字增值稅發票開具有關問題的公告》(國家稅務總局公告2016年第47號)第一條規定：

增值稅一般納稅人開具增值稅專用發票(以下簡稱“專用發票”)後，發生銷貨退回、開票有誤、應稅服務中止等情形但不符合發票作廢條件，或者因銷貨部分退回及發生銷售折讓，需要開具紅字專用發票的，按以下方法處理……

因此，360天只是增值稅專用發票認證期限的限制，並不是對增值稅紅字專用發票開具時間的限制，如果發生了銷售折讓，可以隨時開具增值稅紅字專用發票。

在360天的認證期內可以開紅字發票。但跨年後系統無法找到原來對應的藍字票，你可以在提示未找到後手工重新照原來票的內容錄入，只是數量和金額錄入時前面加個“-”號，然後備註欄裡錄入所衝的藍字票程式碼和號碼。