二者在原理、應用和載體方面有所不同，具體如下：

1、原理不同：

普通聚苯乙烯乳膠和抗體的結合是無選擇性的物理靜電吸附，抗體很難結合到乳膠表面，即使致敏上的抗體也容易從乳膠微球上脫落或者變性失活，而使用多肽縮合劑或交聯劑則操作過程繁瑣、耗時。

膠體金法是由氯金酸(HAuCl4)在還原劑如白磷、抗壞血酸、枸櫞酸鈉、鞣酸等作用下，可聚合成一定大小的金顆粒，並由於靜電作用成為一種穩定的膠體狀態，形成帶負電的疏水膠溶液，由於靜電作用而成為穩定的膠體狀態，故稱膠體金。

2、應用不同：

膠體金也是免疫電鏡技術中較為理想的免疫標記物。膠體金技術具有方便快捷、特異敏感、穩定性強、不需要特殊裝置和試劑、結果判斷直觀等優點, 因而特別適合於廣大基層檢驗人員以及大批次檢測和大面積普查等, 具有巨大的發展潛力和廣闊的應用前景。

乳膠凝集法具有獨特優點: 不需要特殊儀器、肉眼判斷、操作簡便、不需要專門培訓；檢測時間短，一般為 2 min；價格低廉，檢測單份血清樣品的成本比其它血清學和病原學方法低得多；適於現場檢測等，在臨床檢驗中被廣泛應用。

3、載體不同：

乳膠凝集法是以乳膠顆粒作為載體的一種間接凝集試驗。即吸附可溶性抗原於其表面，特異性抗體與之結合後，可產生凝集反應。

膠體金在弱鹼環境下帶負電荷，可與蛋白質分子的正電荷基團形成牢固的結合，由於這種結合是靜電結合，所以不影響蛋白質的生物特性。