首先，預算單位零餘額賬戶要申請開戶；

　　其次，申報稅類時，如果不是零申報時，帳戶內要有足夠款項，否則扣款不成功，會產生滯納金；

　　最後，年度終了，零餘額用款額度必須清零。

　　預算單位零餘額賬戶應用於行政單位會計和事業單位會計中，進行財政授權支付。在辦理授權支付業務時，先由代理銀行根據支付令，透過預算單位“零餘額賬戶”將資金支付到供應商或收款人賬戶。雖然支付指令由單位下達，但財政不再將貨幣資金撥付到預算單位，而是將用款額度劃撥到預算單位的“零餘額賬戶”，於當日營業終了前由代理銀行依照財政部批准的用款額度與國庫單一賬戶清算，財政授權的轉賬業務一律透過預算單位零餘額賬戶辦理。

　　預算單位應設定“零餘額賬戶用款額度”科目。該賬戶可以辦理轉賬、提取現金等結算業務；可以向本單位按賬戶管理規定保留的相應賬戶劃撥工會經費。預算單位可以根據預算載明的用途，將財政補貼住房公積金、醫療保險費透過零餘額賬戶轉入單位基本存款賬戶，再透過基本存款賬戶將有關資金分別劃撥到住房公積金管理中心和社會保險局。代扣個人所得稅由該戶直接上繳。

　　【在預算會計中的賬務處理】

　　假設甲預算單位實行國庫集中收付制度下的財政授權支付。

　　（1）甲預算單位收到代理銀行蓋章的“授權支付到賬通知書”月授權額度為400萬元，該額度記入“零餘額賬戶”和“財政補助收入”。

　　借：零餘額賬戶用款額度 4000000

　　貸：財政補助收入——財政授權支付 4000000

　　（2）甲預算單位購買材料9萬元

　　借：庫存材料 90000

　　貸：零餘額賬戶用款額度 90000

　　（3）甲預算單位購置固定資產16萬元

　　借：事業支出 160000

　　貸：零餘額賬戶用款額度 160000

　　同時

　　借：固定資產 160000

　　貸：固定基金 160000

　　（4）甲預算單位從“零餘額賬戶”提取現金1萬元

　　借：庫存現金 100130

　　貸：零餘額賬戶用款額度 10000

　　　　（5）甲單位報銷差旅費2000元

　　借：事業支出 2000

　　貸：庫存現金 2000