其實簡單的說就是：
古人造的字，古代人常用，但是隨著時間推移現代人不常用了，或者被其他字代替了，後來人就不認識了。
舉個例子：
鴞（xiāo） 就是題主問題提到的鴟鴞chī-xīao、鵂鶹xiū-liú。
今天稍有古文知識的都知道鴞就是貓頭鷹。鳥類分類叫鴞型目，而不叫貓頭鷹型目。取古字而不取俗稱。
詩經《豳風 • 鴟鴞》：鴟鴞鴟鴞，既取我子，無毀我室。
西漢 賈誼《吊屈原賦》：嗚呼哀哉，逢時不祥。鸞鳳伏竄兮，鴟鴞翱翔。
唐 沈佺期《枉系二首》：吾憐姬公旦，非無鴟鴞詩。
南宋 劉過《水調歌頭 • 弓劍出榆塞》：世事只如此，自有識鴞鸞。
元 趙文《上陵》：鴟鴞號荒林，狐狸穴空壙。
明 貝瓊 《殳史吟並引》：石僕麒麟罷官守， 林宿鴟鴞聞鬼語。
清 周龍藻 《孤鶴篇》：鴟鴞搏腐鼠，大嚼自謂豪。
古文中說貓頭鷹一般都是“鴞”（也寫作梟，和鴞差不多意思還有鴟、鴸、鵂等），但是百姓一般不說。
明末清初丁耀亢寫的《續金瓶梅》四十五卷裡有：是個不祥之物，一到人家就沒好事，如鴟鴞一般，人人都叫他做夜貓子。因鴞鳥生的貓頭鳥翼，白日不能見物，到夜裡乘著陰氣害人，因此北方人指鴞鳥為夜貓以比小人兇惡，無人敢近。
這段話說了兩個資訊：1 明朝時已經有了夜貓子這個俗稱。 2 北方人叫鴞為夜貓子。
鴞這個字，中國古人造字時顯然是更重視貓頭鷹那種獨特的叫聲（《毛傳》：惡聲鳥也。），而非外形，但是貓頭鷹這個俗稱則更重視外形。
越古老的名稱越是偏向單字詞，比如魚類：鯉、鯽、鰱、鱅。樹木：梨、棠、梅、桃。器物：盆、盅、盂、盤。古人造字，一個獨立的種類，就會創造一個新字，而不會由代表兩個物種的兩個字相加形容一個物種。同時古人創造這些字的時候，已經考慮這些字的分類，往往同類字會有一個相同的部首，用來表示字的所屬。
這些物品向下進行細分的時候，在前方新增形容詞，即可形成新的詞彙，比如：錦鯉、黃桃、銅盆。而且貓頭鷹這個是由（“貓的頭”+“鷹”）來說明這個物種，既不是貓，也不是鷹。這種命名方法顯然不符合中國古人的命名造字規律。
雖然中國歷史上較早就有了貓的記載，但是直到唐朝才開始豢養，宋代養貓已成流行，許多文獻中皆有養貓記載，藝術作品也有表現。後世元朝統一中原，北方詞彙進入中原，所以我個人認為“貓頭鷹”這種叫法不會早於宋。
“鴞”是原本的中原文化，“貓頭鷹”則是後來北方進入中原的外來文化。外來文化的“貓頭鷹”代替了原本的“鴞”，成為了市井小民主流，但是文人並沒有受到這種外來文化的影響，還是繼續叫“鴞”。
到了後世命名這一類鳥的時候，文化人們自然就選擇了古字而非俗名。這種情況在生物科學命名分類方面尤為明顯。因為命名要選擇明確的、沒有異議的、無可替代的詞彙來準確形容一個種類。比如鴞型目下有：
草鴞科——草鴞屬、慄鴞屬
鴟鴞科——角鴞屬、雕鴞屬、漁鴞屬、雪鴞屬、林鴞屬、眼鏡鴞屬、猛鴞屬、鵂鶹屬、小鴞屬、鬼鴞屬、鷹鴞屬、長耳鴞屬
添一字即可形容種屬，十分方便簡潔，所以在命名分類的時候一般都會使用古字，這也是漢字的魅力。
除此以外就是一些物品已經徹底遠離我們的生活，完完全全不在使用，也會出現大批的生僻字。比如：青銅器。
鼎 鬲 甗 簋 簠 盨 斝 觚 觶 觥 卣 盉 罍 匜 瓿
估計大家也就認識“三足鼎立”的鼎和“觥籌交錯”的觥，這是經常出現在成語中，露臉機會較多。北京人可能還認識一個“簋街”的簋，因為經常吃小龍蝦。剩下的基本上都要去博物館看了，而且就算看見了也未必認識。
青銅器已經徹底退出我們的生活，那麼這些器物的名字，也隨之退出了我們的生活。隨著時間的推移，這些字自然就成了生僻字。
再比如：馬。
馬咱們都認識，可是現代人真正騎過馬的人寥寥無幾，起碼我活了二十幾年就騎過一次。而古人不同，在他們生活中，馬所佔的分量遠遠大於現代人，所以古人在造字的過程中，創造了許許多多有關馬的字。
馹 rì 古代驛站專用的車，後亦指驛馬。
駁 bó 紅白雜毛之馬曰駁。
駘 tái 劣馬曰駘。
駙 fù 幾匹馬共同拉車，在旁邊的馬。
駒 jū 馬二歲曰駒。
駔 zǎng 壯馬也。
驊 huá 驊騮，駿馬。
驕 jiāo 馬高六尺為驕。
駰 yīn 馬陰白雜毛曰駰。
驪 lí 馬深黑色曰驪。
騂 xīng 赤色的馬。
騅 zhuī 馬蒼黑雜毛也。
騭 zhì 牡馬也。
騮 liú 黑鬣、黑尾巴的紅馬。
驃 biāo 黃毛夾雜著白點子的馬。
驄 cōng 青白色的馬。
驤 xiāng 後右蹄白色的馬。
這些字除了驕、駙、駁，因為生成了固定的詞彙還有機會出現，剩下基本不用了。馬這種在古代十分重要的生產生活工具，已經被現在的社會淘汰，它們所使用的相應的字也一起被淘汰了。
鳥類也是這樣，古人在造字的過程中，對鳥類也進行了分類，雖然他們分類不是今天科學意義上的分類，但是為了區分不同種類的鳥也創造了不同的字，但是這些字隨著時間的推移，歷史的發展，或者不再廣泛使用，或者被其他詞彙代替，或者發生異讀，進而產生了變化。更有一些鳥類僅僅是某個地區獨有的，只有當地的人認識，外地人不認識，即便當地的現代人依舊使用這個字，但是因為使用的範圍太小，當外地人看見這些字的，肯定也不認識。
起碼我現在經常看見的鳥就是菜市場的雞鴨鵝，外面亂飛的麻雀和鴿子，還有鄰居家每天早上五點準時溜嗓子的畫眉。
於是生僻字就出現了。
其實簡單的說就是：
古人造的字，古代人常用，但是隨著時間推移現代人不常用了，或者被其他字代替了，後來人就不認識了。
舉個例子：
鴞（xiāo） 就是題主問題提到的鴟鴞chī-xīao、鵂鶹xiū-liú。
今天稍有古文知識的都知道鴞就是貓頭鷹。鳥類分類叫鴞型目，而不叫貓頭鷹型目。取古字而不取俗稱。
詩經《豳風 • 鴟鴞》：鴟鴞鴟鴞，既取我子，無毀我室。
西漢 賈誼《吊屈原賦》：嗚呼哀哉，逢時不祥。鸞鳳伏竄兮，鴟鴞翱翔。
唐 沈佺期《枉系二首》：吾憐姬公旦，非無鴟鴞詩。
南宋 劉過《水調歌頭 • 弓劍出榆塞》：世事只如此，自有識鴞鸞。
元 趙文《上陵》：鴟鴞號荒林，狐狸穴空壙。
明 貝瓊 《殳史吟並引》：石僕麒麟罷官守， 林宿鴟鴞聞鬼語。
清 周龍藻 《孤鶴篇》：鴟鴞搏腐鼠，大嚼自謂豪。
古文中說貓頭鷹一般都是“鴞”（也寫作梟，和鴞差不多意思還有鴟、鴸、鵂等），但是百姓一般不說。
明末清初丁耀亢寫的《續金瓶梅》四十五卷裡有：是個不祥之物，一到人家就沒好事，如鴟鴞一般，人人都叫他做夜貓子。因鴞鳥生的貓頭鳥翼，白日不能見物，到夜裡乘著陰氣害人，因此北方人指鴞鳥為夜貓以比小人兇惡，無人敢近。
這段話說了兩個資訊：1 明朝時已經有了夜貓子這個俗稱。 2 北方人叫鴞為夜貓子。
鴞這個字，中國古人造字時顯然是更重視貓頭鷹那種獨特的叫聲（《毛傳》：惡聲鳥也。），而非外形，但是貓頭鷹這個俗稱則更重視外形。
越古老的名稱越是偏向單字詞，比如魚類：鯉、鯽、鰱、鱅。樹木：梨、棠、梅、桃。器物：盆、盅、盂、盤。古人造字，一個獨立的種類，就會創造一個新字，而不會由代表兩個物種的兩個字相加形容一個物種。同時古人創造這些字的時候，已經考慮這些字的分類，往往同類字會有一個相同的部首，用來表示字的所屬。
這些物品向下進行細分的時候，在前方新增形容詞，即可形成新的詞彙，比如：錦鯉、黃桃、銅盆。而且貓頭鷹這個是由（“貓的頭”+“鷹”）來說明這個物種，既不是貓，也不是鷹。這種命名方法顯然不符合中國古人的命名造字規律。
雖然中國歷史上較早就有了貓的記載，但是直到唐朝才開始豢養，宋代養貓已成流行，許多文獻中皆有養貓記載，藝術作品也有表現。後世元朝統一中原，北方詞彙進入中原，所以我個人認為“貓頭鷹”這種叫法不會早於宋。
“鴞”是原本的中原文化，“貓頭鷹”則是後來北方進入中原的外來文化。外來文化的“貓頭鷹”代替了原本的“鴞”，成為了市井小民主流，但是文人並沒有受到這種外來文化的影響，還是繼續叫“鴞”。
到了後世命名這一類鳥的時候，文化人們自然就選擇了古字而非俗名。這種情況在生物科學命名分類方面尤為明顯。因為命名要選擇明確的、沒有異議的、無可替代的詞彙來準確形容一個種類。比如鴞型目下有：
草鴞科——草鴞屬、慄鴞屬
鴟鴞科——角鴞屬、雕鴞屬、漁鴞屬、雪鴞屬、林鴞屬、眼鏡鴞屬、猛鴞屬、鵂鶹屬、小鴞屬、鬼鴞屬、鷹鴞屬、長耳鴞屬
添一字即可形容種屬，十分方便簡潔，所以在命名分類的時候一般都會使用古字，這也是漢字的魅力。
除此以外就是一些物品已經徹底遠離我們的生活，完完全全不在使用，也會出現大批的生僻字。比如：青銅器。
鼎 鬲 甗 簋 簠 盨 斝 觚 觶 觥 卣 盉 罍 匜 瓿
估計大家也就認識“三足鼎立”的鼎和“觥籌交錯”的觥，這是經常出現在成語中，露臉機會較多。北京人可能還認識一個“簋街”的簋，因為經常吃小龍蝦。剩下的基本上都要去博物館看了，而且就算看見了也未必認識。
青銅器已經徹底退出我們的生活，那麼這些器物的名字，也隨之退出了我們的生活。隨著時間的推移，這些字自然就成了生僻字。
再比如：馬。
馬咱們都認識，可是現代人真正騎過馬的人寥寥無幾，起碼我活了二十幾年就騎過一次。而古人不同，在他們生活中，馬所佔的分量遠遠大於現代人，所以古人在造字的過程中，創造了許許多多有關馬的字。
馹 rì 古代驛站專用的車，後亦指驛馬。
駁 bó 紅白雜毛之馬曰駁。
駘 tái 劣馬曰駘。
駙 fù 幾匹馬共同拉車，在旁邊的馬。
駒 jū 馬二歲曰駒。
駔 zǎng 壯馬也。
驊 huá 驊騮，駿馬。
驕 jiāo 馬高六尺為驕。
駰 yīn 馬陰白雜毛曰駰。
驪 lí 馬深黑色曰驪。
騂 xīng 赤色的馬。
騅 zhuī 馬蒼黑雜毛也。
騭 zhì 牡馬也。
騮 liú 黑鬣、黑尾巴的紅馬。
驃 biāo 黃毛夾雜著白點子的馬。
驄 cōng 青白色的馬。
驤 xiāng 後右蹄白色的馬。
這些字除了驕、駙、駁，因為生成了固定的詞彙還有機會出現，剩下基本不用了。馬這種在古代十分重要的生產生活工具，已經被現在的社會淘汰，它們所使用的相應的字也一起被淘汰了。
鳥類也是這樣，古人在造字的過程中，對鳥類也進行了分類，雖然他們分類不是今天科學意義上的分類，但是為了區分不同種類的鳥也創造了不同的字，但是這些字隨著時間的推移，歷史的發展，或者不再廣泛使用，或者被其他詞彙代替，或者發生異讀，進而產生了變化。更有一些鳥類僅僅是某個地區獨有的，只有當地的人認識，外地人不認識，即便當地的現代人依舊使用這個字，但是因為使用的範圍太小，當外地人看見這些字的，肯定也不認識。
起碼我現在經常看見的鳥就是菜市場的雞鴨鵝，外面亂飛的麻雀和鴿子，還有鄰居家每天早上五點準時溜嗓子的畫眉。
於是生僻字就出現了。